方案摘要:本方案采用巢式逆轉錄 PCR(巢式 RT-PCR)技術,實現對狂犬病毒的高敏感、高特異檢測。適用于人類生前篩查(唾液、腦脊液等)及死后確診(腦組織),亦用于動物狂犬病溯源。結合 Pipetty 電動移液器操作,其精準的移液精度可減少 RNA 提取及 PCR 體系配制中的人為誤差,穩定的移液速度避免樣本飛濺導致的交叉污染,提升批量樣本處理的一致性與效率。該方案結合電動移液器優勢,可高效支持狂犬病確診、動物溯源,為防控提供可靠依據。
方案詳情:
一、實驗原理
狂犬病毒為單鏈負鏈 RNA 病毒,無法直接用常規 PCR 擴增,故采用巢式 RT-PCR 檢測,核心是 “逆轉錄 + 兩輪遞進擴增”。首先通過逆轉錄酶將病毒 RNA 轉化為可擴增的 cDNA;接著第一輪 PCR 用外引物(針對病毒保守基因如 N 基因)擴增 cDNA,得到初步產物;再取少量首輪產物,用結合于首輪產物內部的內引物進行第二輪 PCR。兩輪擴增使目標片段放大 10⁴-10⁶倍,大幅提升敏感性(可檢出低至 10 拷貝 /mL 的病毒 RNA),且內引物僅擴特異片段,徹底排除非特異擴增,顯著提高檢測特異性,適配生前低載量樣本(如唾液)及死后樣本的狂犬病毒檢測。
二、
實驗準備
1、設配和材料
① Pipetty電動移液器MSIC01-03-20,MSIC01-03-250,MSIC01-03-1000;
② A2 型生物安全柜;
③ 小型臺式冷凍離心機;
④ PCR 儀;
⑤ 水平電泳儀;
⑥ 凝膠成像儀;
⑦ 組織勻漿器等。
2、試劑和材料
① 狂大病病毒陽性對照腦組織;
② 狂大病病毒陰性對照腦組織;
③ 特異性擴增引物:
外套上游引物F1:5-GTGTAACACCTCTACAATGG;
外套下游引物R1:5-ACAGTCTCYTCNGCCATCT;
內套上游引物F2:5-CAAGATGTGYGCYAAYTGGAG;
內套下游引物R2:5-AGCCCTGGTTCGAACATTCT。
④ RNA 提取試劑盒或試劑(商品化試劑);
⑤ 一步法 RT-PCR 試劑盒或相應酶類及緩沖液(商品化試劑),包括反轉錄酶、DNA 聚合酶dNTP、反應緩沖液、無 RNA 酶水等;
⑥ PCR試劑盒或相應酶類及緩沖液(商品化試劑),包括 DNA 聚合酶、dNTP、反應緩沖液、無RNA 酶水等;
⑦ TAE 電泳及制膠緩沖液。
三、實驗步驟
1、分別從不同部位待檢腦組織(至少應包含腦干及小腦組織)各取樣品約1g,樣品量少時可取全部組織。剪碎混勻,取其中約1g置組織勻漿器中,加入1mL生理鹽水進行勻漿,以3000g離心2min 后取 100μL,勻漿上清于 1.5 mL滅菌離心管中。使用Pipetty電動移液器,狂犬病病毒陽性和陰性對照腦組織各取 100μL分別置于 1.5 mL 滅菌離心管中。唾液樣品直接取 100μL, 置于 1.5 mL滅菌離心管中。
2、使用Pipetty電動移液器,使用 RNA 提取試劑盒,按試劑盒說明書提取待檢樣品和對照樣品總 RNA。
3、用無 RNA 酶水將引物溶解或稀釋至濃度 10 μmol/L。
4、PCR 擴增
a)外套擴增:使用一步法 RT-PCR 試劑盒,按說明書配制反應體系,進行擴增條件設置。50 ℃反轉錄 30 min;95 ℃預變性 2 min; 95 ℃變性 30 s,55 ℃退火 30 s,72 ℃延伸 90 s,30 個循環;72 ℃終延伸 5 min。
b)內套擴增:使用 PCR 試劑盒,以外套擴增產物1μL為模板,使用Pipetty電動移液器,設置連續分液模式,按說明書配制反應體系,進行擴增條件設置。95 ℃預變性2min;95 ℃變性 30 s,55 ℃退火 30s,72 ℃延伸 30 s,30 個循環;72 ℃終延伸5 min。
c) 擴增產物電泳:取內套擴增產物5 μL~10 μL,加樣于含核酸染色劑的 1.0%瓊脂糖凝膠孔中,另孔加5 μL DNA Marker,以 100 V~120 V電壓于 1×TAE 電泳緩沖液中電泳約20 min,于凝膠成像儀內觀察結果。
四、結果判定
1、狂犬病病毒陽性對照樣品出現 255 bp 擴增條帶、陰性對照樣品無特異擴增條帶時,檢測結果成立。
2、被檢樣品出現 255 bp擴增條帶時判定為狂犬病病毒核酸陽性,否則判定為陰性。