利用DAVID進行GO/KEGG功能富集分析的詳細操作步驟

進入分析主頁面，紅框標注區域就是核心操作區啦～

1. 在「Enter Gene List」框中上傳基因列表，格式要求每行一個基因，且總數量不超過 3000 個；
2. 點擊「Select Identifier」下拉菜單，選擇基因類型 —— 咱們上傳的是基因名（Gene Symbol），所以找到并勾選「OFFICIAL_GENE_SYMBOL」（菜單較長，耐心找找哦）；
3. 「List Type」選項中，直接選中「Gene List」單選框；
4. 點擊「Submit List」提交即可。

     

Step3：查看核心分析結果

操作完成后，就能看到完整分析結果頁啦！紅框里的折疊欄，分別對應 GO（包含 BP、CC、MF 三大類 —— 忘了它們的含義？可以回頭看看《3 分鐘了解 GO/KEGG 功能富集分析》補補課～）和 KEGG 的分析結果，一目了然～
 

 

Step4：提取關鍵結果并下載

做完分析，下一步就是提取目標結果、準備可視化啦！具體操作看這里：

1. 結果頁中，「Gene_Ontology (3 selected)」折疊欄下，藍框標注的「GOTERM_BP_FAT」「GOTERM_CC_FAT」「GOTERM_MF_FAT」，就是我們需要的 GO 功能富集結果；
2. 「Pathways (3 selected)」折疊欄里，藍框的「KEGG_PATHWAY」就是 KEGG 的核心結果；
3. 想查看每個類別（BP/CC/MF/KEGG）的詳細數據？點擊對應欄目后的「Chart」按鈕（綠框所示）就行～

​

點擊「Chart」后，會顯示包含多列數據的詳細結果表，核心關注這幾列：

• 關鍵列：Term（GO/KEGG 功能術語）、P-Value（統計顯著性）；
• 輔助列：Count（富集的基因數量）、%（富集基因占比）。

想下載結果？點擊紅框中的「Download File」，會彈出一個純文本格式的結果頁（看似雜亂但數據完整），直接下載或導入作圖軟件，就能進行后續分析啦～
 

 

Step5：結果導出與可視化

各位科研小伙伴看文獻時，肯定見過不少功能富集分析的圖吧？柱狀圖、高級氣泡圖是不是很常見？還有人在用 Excel、PPT 慢慢作圖嗎？

下面這種高顏值、高專業度的圖，是不是正是你想要的？
 

樂備實是國內專注于提供高質量蛋白檢測以及組學分析服務的實驗服務專家，自2018年成立以來，樂備實不斷尋求突破，公司的服務技術平臺已擴展到單細胞測序、空間多組學、流式檢測、超敏電化學發光、Luminex多因子檢測、抗體芯片、PCR Array、ELISA、Elispot、PLA蛋白互作、多色免疫組化、DSP空間多組學等30多個，建立起了一套涵蓋基因、蛋白、細胞以及組織水平實驗的完整檢測體系。