細(xì)胞系STR鑒定的標(biāo)準(zhǔn)和數(shù)據(jù)庫資源
瀏覽次數(shù):322 發(fā)布日期:2025-10-11
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為什么進(jìn)行細(xì)胞系STR鑒定?
細(xì)胞系STR鑒定主要用于確保細(xì)胞身份的準(zhǔn)確性和純度,避免因交叉污染或錯(cuò)誤使用細(xì)胞系導(dǎo)致實(shí)驗(yàn)結(jié)果偏差。之前一些已經(jīng)發(fā)表的期刊的文章也曾使用了錯(cuò)誤的細(xì)胞品系,導(dǎo)致實(shí)驗(yàn)結(jié)果的偏差。ATCC等國際機(jī)構(gòu)將STR鑒定作為細(xì)胞鑒定的標(biāo)準(zhǔn)方法,要求實(shí)驗(yàn)室在發(fā)表文章前必須完成鑒定。一些重要的期刊也要求提供細(xì)胞鑒定的報(bào)告。
細(xì)胞系鑒定相關(guān)的組織、機(jī)構(gòu)以及標(biāo)準(zhǔn)
ANSI/ATCC ASN-0002-2011由美國國家標(biāo)準(zhǔn)學(xué)會(huì) US-ANSI 發(fā)布于 2011,標(biāo)準(zhǔn)設(shè)立了人類細(xì)胞系身份認(rèn)證檢測(cè)的最佳方法,ANSI/ATCC ASN-0002-2021版本是其更新版本。
ATCC成立于1925年,是一家非盈利生物標(biāo)準(zhǔn)品資源中心。ATCC向全球發(fā)布其獲取、鑒定、保存及開發(fā)的生物標(biāo)準(zhǔn)品。
國際細(xì)胞系身份認(rèn)證委員會(huì)(ICLAC,The International Cell Line Authentication Committee)是2012年成立的組織,該組織建立有網(wǎng)站,用于登記交叉污染細(xì)胞及錯(cuò)誤鑒定的細(xì)胞。強(qiáng)化大家使用正確細(xì)胞的認(rèn)識(shí),促進(jìn)細(xì)胞身份認(rèn)證檢測(cè)開展,減少及至杜絕錯(cuò)誤細(xì)胞的使用。
細(xì)胞系品系相關(guān)網(wǎng)站,Cellosaurus 網(wǎng)站2025年8月更新的資料顯示包含122193 human細(xì)胞系, 30558 小鼠細(xì)胞系, 3191 大鼠細(xì)胞系的信息。
以上組織、機(jī)構(gòu)、網(wǎng)站在細(xì)胞系的鑒定和認(rèn)證、查詢方面起了重要的作用,在細(xì)胞鑒定領(lǐng)域做出了很大的貢獻(xiàn),并且與時(shí)俱進(jìn)不斷的更新數(shù)據(jù)。
什么情況下需要做細(xì)胞系鑒定?
- 實(shí)驗(yàn)室剛購買的細(xì)胞系;
- 新構(gòu)建的細(xì)胞系;
- 來源可疑的細(xì)胞系;
- 實(shí)驗(yàn)項(xiàng)目開始前;
- 細(xì)胞系長期凍存后,準(zhǔn)備再次使用前;
- 細(xì)胞系傳代次數(shù)超過5代以上;
- 文章發(fā)表投稿前;
- 細(xì)胞系表型出現(xiàn)異常變化
細(xì)胞系鑒定時(shí)交叉污染確認(rèn)
細(xì)胞品系STR鑒定不但可以確認(rèn)細(xì)胞系的身份,也能在檢測(cè)中發(fā)現(xiàn)是否存在交叉污染,一般來說,若STR分型圖譜兩個(gè)以上的STR位點(diǎn)同時(shí)出現(xiàn)了多等位基因的現(xiàn)象,提示細(xì)胞系可能存在交叉污染,當(dāng)然特殊細(xì)胞系除外。
人源和鼠源細(xì)胞系STR鑒定相關(guān)的位點(diǎn)
人源細(xì)胞系STR鑒定比對(duì)的核心位點(diǎn)數(shù)量是9個(gè)或13個(gè),包含了很多STR位點(diǎn),ANSI/ATCC ASN-0002-2011標(biāo)準(zhǔn)中包含9個(gè)位點(diǎn):Amelogenin、CSF1PO、D5S818、D7S820、D13S317、D16S539、TH01、TPOX、vWA,其中Amelogenin是性別相關(guān)的位點(diǎn)。更新的ANSI/ATCC ASN-0002-2021標(biāo)準(zhǔn)中包含了13個(gè)位點(diǎn):CSF1PO、D3S1358、D5S818、D7S820、D8S1179、D13S317、D16S539、D18S51、D21S11、FGA、TH01、TPOX、vWA,不包含Amelogenin位點(diǎn),但是也將Amelogenin作為性別相關(guān)的位點(diǎn)。翼和生物檢測(cè)的位點(diǎn)更多,包括Amelogenin位點(diǎn)和其他的20個(gè)相關(guān)位點(diǎn)。除了上述的13個(gè)位點(diǎn)之外,翼和生物檢測(cè)的STR位點(diǎn)還包括D1S1656、D2S1338、D6S1043、D12S391、D19S433、Penta D、Penta E 這7個(gè)額外的位點(diǎn),提升了人源細(xì)胞的鑒定能力。
鼠細(xì)胞系STR鑒定一般來說位點(diǎn)數(shù)量是8個(gè)或18個(gè),一般說來包含8個(gè)STR位點(diǎn):4-2、6-4、6-7、5-5、12-1、18-3、15-3、X-1。18個(gè)位點(diǎn)則是在以上基礎(chǔ)上增加10個(gè)位點(diǎn):1-1、2-1、17-2、11-2、8-1、19-2、7-1、1-2、13-1、3-2 位點(diǎn)。翼和生物檢測(cè)鼠源細(xì)胞的18個(gè)STR位點(diǎn),提升了鼠來源細(xì)胞的鑒定能力。