1、 引言
細(xì)菌定量是醫(yī)療健康、農(nóng)業(yè)生產(chǎn)、食品加工及工業(yè)領(lǐng)域的基礎(chǔ)檢測項目。無論是益生菌中活性干酪乳桿菌的精準(zhǔn)計量、疫苗中滅活霍亂弧菌的定量檢測、污水處理用硫氧化菌的效能評估,抑或土壤污染監(jiān)測中的常規(guī)菌群分析,乃至實驗室標(biāo)準(zhǔn)菌懸液的濃度測定,細(xì)菌計數(shù)均是關(guān)鍵步驟。本文對比三種傳統(tǒng)細(xì)菌檢測方法,并介紹一種快速自動化定量解決方案。
細(xì)菌定量最常用的方法之一是統(tǒng)計菌落形成單位(CFUs)。這種廣泛使用的方法操作簡單,能夠很好地反映細(xì)胞的活性情況,并且對低濃度細(xì)菌也具有很高的靈敏度。然而,該方法依賴于培養(yǎng)基和培養(yǎng)條件,并且僅限于可培養(yǎng)的細(xì)菌,這使得存活但不可培養(yǎng)(VBNC)菌株無法被檢測。另一個主要缺點是該方法通常需要數(shù)天時間才能得到結(jié)果,而這些結(jié)果也只是估算值。一塊菌落可能來源于一個細(xì)胞,也可能來源于上千個細(xì)胞。此外,樣本制備過程因技術(shù)人員的操作差異以及樣本條件的不同而可能存在變動。對于諸如食品或水污染等需要快速響應(yīng)的時效性問題而言,這種耗時的特點是一個顯著的缺陷。
采用Petroff-Hausser或Levy等專用計數(shù)板直接顯微計數(shù),這種細(xì)胞計數(shù)的“金標(biāo)準(zhǔn)”是一種相對快速、簡單的方法,可獲得結(jié)果。然而,該方法操作繁瑣,并且容易受到操作者之間差異的影響。細(xì)菌體積微小,不僅某些物種即使在顯微鏡下難以觀察,同時還會導(dǎo)致細(xì)菌在計數(shù)腔內(nèi)移動,并分布于不同的焦平面上,從而難以評估和控制每次細(xì)胞復(fù)制時計數(shù)的準(zhǔn)確性。
流式細(xì)胞儀被認(rèn)為是確定總細(xì)胞數(shù)和活細(xì)胞數(shù)最為準(zhǔn)確的方法之一。然而,這種方法中操作儀器和分析數(shù)據(jù)都需要廣泛的培訓(xùn)。與菌落計數(shù)類似,流式細(xì)胞儀的一個顯著局限性是無法區(qū)分單個細(xì)胞和細(xì)胞團。每個粒子均記錄為單一事件,因此,聚集的球菌或鏈狀的桿菌無法被識別為單個細(xì)胞。
- QUANTOM Tx™微生物細(xì)胞計數(shù)儀
QUANTOM Tx微生物細(xì)胞計數(shù)儀是一款基于圖像的自動化細(xì)胞計數(shù)設(shè)備,能夠在數(shù)分鐘內(nèi)識別并計數(shù)單個細(xì)菌細(xì)胞。QUANTOM Tx可自動對熒光染色的細(xì)胞進(jìn)行聚焦、成像和多圖像分析,以高靈敏度和高精確度檢測細(xì)菌細(xì)胞。其先進(jìn)的細(xì)胞檢測與解聚算法,即使在最緊密的細(xì)胞聚集體中,也能準(zhǔn)確識別單個細(xì)菌細(xì)胞。通過使用兩種不同的染料,QUANTOM Tx可以分別計數(shù)總細(xì)胞數(shù)或活細(xì)胞數(shù)。染色后的細(xì)胞與QUANTOM細(xì)胞加載緩沖液I混合后,被加載到QUANTOM M50細(xì)胞計數(shù)載片中,并使用QUANTOM離心機進(jìn)行離心處理,從而將細(xì)胞固定并均勻分布在單一焦平面上,確保精確的細(xì)胞檢測。計數(shù)結(jié)果和圖像可在計數(shù)完成后立即查看和保存。
用QUANTOM Tx™微生物細(xì)胞計數(shù)儀計數(shù)
2、 QUANTOM Tx對標(biāo)準(zhǔn)微球計數(shù)的精準(zhǔn)測定
通過計數(shù)已知濃度的標(biāo)準(zhǔn)熒光微球,驗證了QUANTOM Tx的計數(shù)準(zhǔn)確性。實驗中,微球經(jīng)系列稀釋后與QUANTOM細(xì)胞加載緩沖液I混合,并加載到QUANTOM M50細(xì)胞計數(shù)載片中。載片在QUANTOM離心機中以300×g(RCF)離心10分鐘,以確保微球均勻分布,隨后使用以下參數(shù)在QUANTOM Tx上進(jìn)行計數(shù):LED設(shè)置為“Bead(微球)”、粒徑范圍為1-50μm、檢測靈敏度為0、解聚等級為7、圓度為30%。所有計數(shù)均進(jìn)行了三次重復(fù)。正如圖1所示,QUANTOM Tx的計數(shù)結(jié)果與微球的理論濃度呈現(xiàn)出高度相關(guān)性(R² = 0.9997)。
圖1. 已知標(biāo)準(zhǔn)微球濃度與QUANTOM Tx結(jié)果之間的相關(guān)性
3、 與流式細(xì)胞儀和血球計數(shù)板的準(zhǔn)確性及變異性比較
為了比較QUANTOM Tx與流式細(xì)胞儀和血球計數(shù)板的計數(shù)準(zhǔn)確性,對大腸桿菌進(jìn)行了三次重復(fù)的系列稀釋計數(shù)。對于流式細(xì)胞儀,使用噻唑橙(Thiazol Orange)對細(xì)胞進(jìn)行染色,并使用FACSCalibur流式細(xì)胞儀(BD Biosciences)進(jìn)行計數(shù),同時加入標(biāo)準(zhǔn)微球以幫助確定細(xì)胞濃度。對于血球計數(shù)板,細(xì)胞被加載到Petroff-Hausser計數(shù)板(20 μm,Hausser Scientific)中,并通過CELENA S數(shù)字成像系統(tǒng)(Logos Biosystems)使用TC PlanAchro 20倍物鏡進(jìn)行成像,計數(shù)了Neubauer計數(shù)網(wǎng)格中的五個小格。對于QUANTOM Tx,細(xì)胞使用QUANTOM總?cè)旧玖线M(jìn)行染色,并使用以下參數(shù)進(jìn)行計數(shù):LED強度=5,粒徑范圍=0.3-50 μm,檢測靈敏度=0,解聚等級=0,圓度=0%。結(jié)果顯示,總細(xì)胞濃度的計數(shù)結(jié)果之間沒有顯著差異,但隨著細(xì)胞濃度的增加,血球計數(shù)板的計數(shù)結(jié)果變異性較高,而QUANTOM Tx和流式細(xì)胞儀的結(jié)果則更加一致(圖2)。
圖2. QUANTOM Tx、流式細(xì)胞儀和血球計數(shù)板的計數(shù)結(jié)果比較。
4、 可調(diào)節(jié)的檢測方案適用于各種形態(tài)和排列方式的細(xì)菌細(xì)胞
為了展示QUANTOM Tx的多功能性,不同種類的細(xì)菌使用QUANTOM總?cè)旧玖线M(jìn)行染色,并通過QUANTOM Tx進(jìn)行計數(shù)。QUANTOM Tx能夠在每次計數(shù)中自動捕獲、分析并標(biāo)注多達(dá)20張高分辨率圖像,使得研究人員可以輕松地通過視覺驗證每次計數(shù)的準(zhǔn)確性。以干酪乳桿菌(Lactobacillus casei)為例,使用以下參數(shù)進(jìn)行計數(shù):LED強度=5,粒徑范圍=1-50 μm,檢測靈敏度=0,解聚等級=7,圓度=0。對于巨大芽孢桿菌(Bacillus megaterium),使用的參數(shù)為:LED強度=5,粒徑范圍=1-50 μm,檢測靈敏度=3,解聚等級=10,圓度=0。更多細(xì)菌種類及其對應(yīng)的參數(shù)設(shè)置可參見:goo.gl/ixr8kr。如圖3所示,QUANTOM Tx利用解聚功能能夠在緊密排列的桿菌鏈中精準(zhǔn)分辨出單個細(xì)胞。
圖3. 使用QUANTOM Tx的解聚功能檢測桿菌鏈中的單個細(xì)胞。左圖為干酪乳桿菌(Lactobacillus casei),右圖為巨大芽孢桿菌(Bacillus megaterium),解聚等級分別設(shè)置為7和10。
5、 結(jié)論
細(xì)菌是一類極其多樣化的生物,具有多種多樣的形態(tài)、大小和排列方式,這使得自動化細(xì)胞計數(shù)成為一項充滿挑戰(zhàn)的任務(wù)。傳統(tǒng)的菌落計數(shù)方法不僅耗時,而且其結(jié)果充其量只能算作一種不可靠的估算。即使是流式細(xì)胞儀,也會將每個粒子(無論是單個細(xì)胞還是聚集體)都記錄為一個單獨的事件。血球計數(shù)板操作耗時,并且容易受到操作者間變異的影響。QUANTOM Tx微生物細(xì)胞計數(shù)儀能夠高效、準(zhǔn)確且快速地對各種形態(tài)和排列方式的細(xì)菌進(jìn)行定量分析。這使得QUANTOM Tx成為一種重要且必需的工具,可用于樣本中細(xì)菌群體的即時、實時評估。

使用QUANTOM Tx測試的部分細(xì)菌列表