疾病進程中實質細胞表型的病理改變是疾病機制研究的核心挑戰,而空間多組學技術正為解析這一過程提供全新的視角。本文分享的系統性研究思路,通過整合病理學分析、單細胞測序與CosMx空間分子成像(SMI)技術,構建了從組織形態到分子通路的完整研究框架,精準揭示疾病誘導實質細胞表型改變的分子機制。
一、研究思路
二. 研究思路詳解
1、為了解析疾病誘導實質細胞表型發生了怎樣的改變,首先對疾病組織進行病理分析,鑒定組織結構和形態的變化特征,并將顯著發生病理變化的組織區域標記。接下來,對疾病組織和正常對照組織進行單細胞轉錄組測序,對帶有標記區域的疾病組織切片和正常對照組織切片進行CosMx SMI空間轉錄組檢測,整合兩部分數據獲得空間單細胞轉錄組圖譜。
圖1 空間單細胞轉錄組注釋結果示例
圖2 疾病組織vs正常組織實質細胞及候選上游細胞差異分析結果示例
圖3 空間細胞互作分析及驗證實驗結果示例