高同源SNP分型-多重長片段PCR打斷建庫技術

同源區域中的單核苷酸多態性在遺傳學研究中發揮著至關重要的作用。然而，由于基因組中存在重復序列，對這些SNP進行基因分型頗具挑戰性，需要采用特定的方法。
翼和生物技術團隊開發的多重長片段PCR打斷建庫技術可以高效且準確地進行SNP基因分型而免受高同源區段影響（Lu, M., Li, J., Sun, X., Zhao, D., Zong, H., Tang, C., Li, K., Zhou, Y., & Xiao, J. (2024). Genotyping single nucleotide polymorphisms in homologous regions using multiplex kb level amplicon capture sequencing. Molecular genetics and genomics : MGG, 299 1, 99 .）。這是一種新型的中通量技術，“多重”——在一個反應管中，一次性捕獲10個左右特異性片段。“長片段”——能擴增出5k-10k片段，跨過高同源區，讀到目的片段核苷酸的完整序列。捕獲之后可以通過二代高通量測序大幅度提升獲得高同源區段SNP精準信息的能力。此外，這也代表多重長片段技術所需樣本消耗更少，更節約成本。
 
高同源區段SNP應用多重長PCR捕獲建庫技術，完美結合了長PCR和多重PCR，吸收了兩種方法的優點，首次挑戰并建立了一種新的靶向捕獲建庫二代測序的方案，具有5大優勢：長PCR跨同源區捕獲，大區間低成本覆蓋，少量樣本經濟性，復雜變異檢測，實驗周期明顯縮短。