百蓁生物全面解碼豬免疫肽組研究，賦能疫苗開發和瘟病防控
免疫肽組是指對有核細胞在參與抗原呈遞途徑中的MHC I類或II類蛋白質上呈遞全部多肽的研究，對于探究了解細胞介導和體液反應中的免疫原性表位至關重要。對 I 類和 II 類免疫肽的動力學和組成的研究，不僅能夠發現個性化癌癥免疫療法的靶點（例如來自腫瘤特異性突變的新抗原或腫瘤相關抗原），還有助于開發新的mRNA /多肽疫苗和免疫細胞療法。目前，在該領域人和小鼠研究的比較多，但很少有研究涉及其他物種。
豬作為重要經濟動物，常受非洲豬瘟（ASFV）、藍耳病（PRRSV）、豬瘟（CSFV）等高致死率病毒威脅，以及細菌感染（如豬鏈球菌）和免疫抑制性疾病（如PCVAD）影響，導致養殖業巨額損失并引發公共衛生風險。豬免疫肽組學檢測在疫苗開發和疾病防控機制研究方面具有重要的應用價值，為豬病防控和豬群健康管理提供了有力的技術支持。
此外，豬還在人類疾病健康研究中發揮著不可替代的作用，其解剖學和生理學特征與人類高度相似，是研究心血管疾病、神經系統疾病、糖尿病、異種器官移植的理想模型，其免疫肽組學研究可以幫助揭示人類疾病中的免疫反應機制。
通過對豬免疫肽組的深入研究，可以更好地理解免疫系統的復雜性和多樣性，揭示免疫反應的分子機制。這些基礎研究成果不僅對豬的健康養殖有重要意義，也為人類免疫學研究提供了參考。豬的MHC分子被稱為豬白細胞抗原（SLA），其結構和功能與人類的HLA（人類白細胞抗原）非常相似。SLA I類基因，主要包括 SLA-1、SLA-2 和 SLA-3，這些基因編碼的蛋白質在所有有核細胞表面表達，主要負責呈遞內源性抗原肽段給CD8+細胞毒性T淋巴細胞（CTLs），從而啟動細胞免疫反應。SLA II類基因，包括 SLA-DR、DQ、DM 和 DO，這些基因編碼的蛋白質主要在專職抗原呈遞細胞（如樹突狀細胞、巨噬細胞和B淋巴細胞）表面表達，負責呈遞外源性抗原肽段給CD4+輔助性T細胞。
圖1. 豬SLA分子（DOI: 10.1146/annurev-animal-020518-115014）
百蓁生物迎來重大升級，其免疫肽的檢測范圍從人和小鼠的物種進一步拓展至豬的物種，為客戶提供從樣品處理到抗原發現的完整解決方案。該平臺從SLA-I/II抗體開發、樣本制備與液質分析方法以及數據解析全流程進行針對性優化，使平臺技術能應用于豬源免疫肽深度檢測、豬源遞呈病原體免疫肽深度檢測等研究。
圖2. 百蓁生物兼容MHC分型與樣本類型
通過對豬的PBMC細胞系進行蛋白提取，之后使用特異性抗體對SLA復合物進行免疫沉淀（WB結果如圖3所示），分離出與SLA結合的肽段并進行質譜檢測。檢測結果顯示，鑒定到肽段的長度以 9個氨基酸為主，符合經典的 MHC I型抗原肽長度的分布。
圖3. SLA-I WB圖(β2m)和鑒定肽段分布
對免疫肽進一步的分型分析，結果顯示每個分型中都有較多肽段的支持，結合的肽段的數目占9個氨基酸肽段數目的80%左右（圖4），說明富集效果較好。
圖4. 肽段與SLA分型結合分析
豬免疫肽組學檢測在多個領域具有廣泛的應用。在疫苗開發方面，通過鑒定MHC呈遞的肽段，可以發現潛在的抗原表位，從而設計出更有效的疫苗。在疾病防控方面，免疫肽組學檢測可以幫助研究人員了解豬在感染病原體后的免疫反應機制。通過對感染細胞的免疫肽組進行分析，可以鑒定出病原體特異性的肽段，從而為疾病的早期診斷和治療提供依據。免疫肽組學檢測還為個性化醫療提供了可能。通過對個體豬的免疫肽組進行分析，可以發現與疾病相關的特異性肽段，從而為精準治療提供指導。
近期，哥倫比亞國立大學Manuel A. Patarroyo研究團隊利用質譜技術對沙門氏菌感染豬的免疫肽進行研究（Biology 2024, 13, 832），以尋找與SLA-II類結合的細菌候選抗原肽（如圖4所示）。通過免疫肽技術共鑒定出31個獨特的沙門氏菌MHC II型的抗原肽（表格1），鑒定出的這些細菌抗原肽可以作為開發針對沙門氏菌感染的新型肽段亞單位疫苗的潛在候選者，對于控制豬沙門氏菌病具有重要意義。
圖5. 利用質譜技術對沙門氏菌感染豬的免疫肽進行研究
表格1. 沙門氏菌MHC II細菌抗原肽
新抗原發現完整解決方案
百蓁生物為客戶提供從樣品處理到新抗原發現的完整解決方案：利用質譜檢測的方法進行免疫肽組的解析，再結合特有的AI算法發現新抗原，并對免疫原性進行預測，為下游的細胞學靶點驗證提供更精準的新抗原候選列表。DeepImmu®️技術平臺首創的基于DeepNovo®️的數據分析流程，特別對于傳統基因組、轉錄組、核糖體組等測序結果以外的non-canonical免疫多肽具有準確的分析能力，而這些non-canonical免疫多肽更是腫瘤復發以及腫瘤特異的抗原的來源。
多 鑒定深度超越30000+免疫多肽，突破10mg組織樣品極限（5000+多肽）
快 最快四周實現從樣本處理到新抗原驗證的完整解決方案（含細胞水平驗證）
好 實驗重現性好，免疫肽富集有效性高，譜圖質量好，全流程質控
準 AI賦能的新抗原免疫原性預測，驅動高效的驗證平臺，篩選新抗原更準確
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