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          羅氏FFPE 組織切片核酸純化試劑盒操作說明

          瀏覽次數:7280 發布日期:2015-4-6  來源:本站 僅供參考,謝絕轉載,否則責任自負

          High Pure FFPET DNA Isolation Kit基于離心柱法的抽提原理,免去DNA沉淀和有機試劑抽提的步驟,是快速核酸抽提的理想工具。

          整個抽提過程僅需3小時(含脫蠟過程);
          獲得高DNA得率和質量;
          在qPCR,芯片分析和測序等下游應用中獲得強大信號。


          圖1:從FFPET樣本中獲得高得率的DNA

          柱形圖顯示了從3種不同乳腺癌或結腸癌異種移植組織的5um FFPET組織切片樣品中獲得的DNA平均得率。通常來說,在不同組織切片的樣品個體間存在一定的DNA得率變異。

          圖2:從樣品中抽提獲得高質量DNA,適用于多種下游應用。
          在HT29異種移植FFPET樣本中抽提獲得DNA,再進行100,200,300,400bp片段長度擴增子的多重PCR。
          泳道1和2:使用二甲苯進行脫蠟
          泳道3和4:使用十六烷進行脫蠟
          泳道5和6:多重PCR質控對照,核酸樣品為人全血中抽提的完整基因組DNA
          圖2:從近期和長期保存的FFPET樣品中均可抽提獲得高RNA得率

          結果:所有泳道中均出現4個清晰的目標條帶,表明High Pure FFPET DNA Isolation Kit能在FFPET樣本中抽提獲得高質量DNA,適用于CGH芯片分析,二代測序等對核酸模板質量要求高的下游應用。

          圖3:從樣品中抽提獲得高質量DNA,提高qPCR檢測靈敏度

          作為qPCR實驗中的核酸模板,要求高質量DNA,即良好的核酸得率、純度和片段大小分布,并能高靈敏度和不偏倚地檢測到目標基因。取5ul DNA洗脫液,分別通過LightCycler 480 Real-Time PCR Instrument擴增檢測CycA(442bp)或myo(89bp)基因片段。
          結果:High Pure FFPET DNA Isolation Kit抽提獲得的DNA樣品能在qPCR研究中獲得更高的檢測靈敏度(提前出線的Cq值)。

          圖4:將DNA應用于甲基化敏感性高分辨率熔解曲線分析(MS-HRM)等前沿應用

          將不同腫瘤研究樣本的DNA抽提物經重亞硫酸鹽處理,通過LightCycler 480 Instrument進行APC基因的MS-HRM分析,不同腫瘤組織的APC基因具有不同程度的甲基化。

          結果:使用High Pure FFPET DNA Isolation Kit抽提獲得的DNA是MS-HRM分析的理想模板。在該研究中,共發現3中不同程度的甲基化范圍:樣本A的APC甲基化水平在10-100%,樣本B的甲基化水平在0-1%,樣本C的APC不存在甲基化。

          產品信息

          產品

          目錄號

          包裝規格

          High Pure FFPET DNA Isolation Kit

          06 650 767 001

          50次抽提反應。

          閱讀原文:http://www.liankebio.com/ProductCenterShow/articleID/2015040006.html

          發布者:杭州聯科生物技術股份有限公司
          聯系電話:4006721600
          E-mail:network@liankebio.com

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