DSP空間多組學技術(shù)的常見問題及項目經(jīng)驗總結(jié)

上期我們分享了“空間組學樣本制備指南 | 打造完美切片：DSP技術(shù)樣本處理全攻略”
本期我們將大家常見的問題以及項目經(jīng)驗為大家整理成了FAQ，趁熱打鐵與您分享！

1、DSP（Digital Spatial Profiling）是一個空間多組學技術(shù)，這些組學可以同時檢測嗎？具體包含哪些組學呢？
答：可以在一張切片同時檢測轉(zhuǎn)錄組和蛋白組。包含哪些具體組學產(chǎn)品見下圖1。

2、ROI和AOI有什么區(qū)別呢？
答：在 Digital Spatial Profiling (DSP) 技術(shù)中，ROI（Region of Interest）是指在組織切片上由研究者根據(jù)形態(tài)學特征或標記物選擇的感興趣區(qū)域，是進行空間分子分析的總體框架。

AOI（Area of Illumination/Analysis）則是 ROI 內(nèi)部進一步定義的分析單元，代表實際進行熒光照射、寡核苷酸釋放及分子信息采集的空間范圍。

換言之，ROI 是“宏觀選區(qū)”，決定研究的整體區(qū)域；AOI 是“微觀劃分”，決定數(shù)據(jù)獲取的精細尺度。二者的合理結(jié)合可實現(xiàn)從組織結(jié)構(gòu)層面到分子分辨層面的空間多組學解析。（具體可全選圈選模式見下圖2）

3、DSP成像marker可以自由選擇嗎？
答：不完全自由，主要受熒光通道的限制。DSP主要包含以下四種熒光通道：

4、DSP實際圈選的界面怎么操作？
答：（1）ROI/AOI圈選主界面。

（2）ROI圈選模式-多種可選

   
（3）ROI菜單（根據(jù)形狀）
ROI菜單內(nèi)容：①ROI名稱、坐標及尺寸；②圈選面積&包含核數(shù)；③備注等其他信息（可選）；④AOI信息（可選）；⑤不超過660×770μm

（4）AOI菜單（根據(jù)顏色）
AOI定義：通道之間的邏輯運算；
通道閾值是所有ROI通用

（5）渲染設(shè)置內(nèi)容：
①Min&Max：明暗度和對比度；
②不同樣本或ROI可靈活調(diào)整
“空間維度+多組學”-高分中標公式!

本期分享挑選了top問題進行解答，若您對DSP有其他疑問，請隨時聯(lián)系小備~

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樂備實是國內(nèi)專注于提供高質(zhì)量蛋白檢測以及組學分析服務(wù)的實驗服務(wù)專家，自2018年成立以來，樂備實不斷尋求突破，公司的服務(wù)技術(shù)平臺已擴展到單細胞測序、空間多組學、流式檢測、超敏電化學發(fā)光、Luminex多因子檢測、抗體芯片、PCR Array、ELISA、Elispot、PLA蛋白互作、多色免疫組化、DSP空間多組學等30多個，建立起了一套涵蓋基因、蛋白、細胞以及組織水平實驗的完整檢測體系。

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