土壤代謝組學（soilomics）是指用代謝組學的方法研究土壤中有機質及土壤微生物代謝含量變化及相互作用的一門科學。土壤微生物是土壤不可缺少的組成部分，是陸地生態系統中的分解者和調節者，能夠參與生態系統的物質循環以及能量流動，其分布及活性揭示土壤的變化規律和演變趨勢。研究土壤微生物碳代謝功能特征可以了解微生物多樣性及其碳代謝能力，為探索調節、控制和改善土壤環境質量提供重要的參考。
技術優勢
前處理經驗豐富：能充分提取出土壤中的代謝物；
檢測種類多：可檢測土壤中多類代謝物。
技術路線
技術參數
樣本要求
土壤樣本 1-10 g/sampl
生物學重復
不低于6個生物學重復
檢測平臺
GC-TOF-MS（Agilent 7890B-LECO Peagsus HT/BT）
應用方向
1、土壤有機質及微生物成分分析；
2、土壤微生物代謝通路研究；
3、土壤生物多樣性及功能；
4、污水土地處理系統代謝機制研究。
案例分析
利用定量代謝組分析土壤代謝鑒定土壤基質
體外代謝組可以分析土壤細菌產生的低分子量有機物質的組成。本研究從腐殖質土壤中收集水溶性土壤微生物代謝物建立一種用非目標特征鑒定土壤基質的方法。用液相色譜質譜（LC/MS）和氣相色譜質譜（GC/MS）鑒定到96種代謝物，代謝物定量信息可用于鑒別兩種土壤基質（SDM）。這種方法也可以應用于鑒別不同特征的微生物群落。
參考文獻
Jenkins S, Swenson T L, Lau R, et al. Construction of Viable Soil Defined Media Using Quantitative Metabolomics Analysis of Soil Metabolites[J]. Frontiers in Microbiology, 2017,8.
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