羅氏推出新的v2.8軟件 GS FLX+系統(tǒng)測序表現(xiàn)更優(yōu)秀
GS FLX+ 2.8軟件帶來更多的出色表現(xiàn)
GS FLX+系統(tǒng)連續(xù)創(chuàng)新，基于同樣的機器，相同的化學反應，推出新的v2.8軟件，帶來更優(yōu)秀的測序表現(xiàn)。目前基于軟件的優(yōu)化可達到穩(wěn)定的高質(zhì)量，更長讀長的Shotgun測序結(jié)果。
更長的讀長更易于檢測復雜基因組的全新變異，可對基因組、轉(zhuǎn)錄組和宏基因組學研究中一些測序困難的區(qū)域進行分析。
| 圖1 GS FLX+系統(tǒng)用2.8軟件對人DNA樣本進行測序后的結(jié)果。曲線顯示出堿基數(shù)隨著序列長度的分布情況。藍色部分與陰影交界處可看出50%的總堿基數(shù)與序列長度對應關(guān)系。不同測序結(jié)果與樣本特性與基因組特性有關(guān)。 |
除了更長讀長的表現(xiàn)，v2.8在GS Reference Mapper軟件中增加了對多樣本結(jié)果分離的功能，以及SNP檢測效果上的提升。在GS Amplicon Variant Analyzer軟件中增加了對單堿基插入缺失的自動查找，提供更加簡便的Amplicon測序分析流程的構(gòu)建。
許多升級至v2.8的用戶都表示，v2.8的軟件能帶來讀長上約200bp的提升，總體測序量上約20%的增加，454測序的超長讀長在全基因組denovo拼接、cDNA拼接和可變剪切的檢測方面都有優(yōu)秀表現(xiàn)。
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