Cell文章分享：LabEx多技術協同解析CAR-T治療多發性硬化免疫重塑
在最新的一項由華中科技大學同濟醫學院附屬同濟醫院團隊發表的 Cell 研究（Qin et al., 2025）中，研究團隊針對進行性多發性硬化（PMS）患者，通過抗 BCMA CAR-T 治療聯合多組學檢測，繪制出一條完整的免疫重塑路線圖。值得關注的是：從單細胞機制探索到Luminex 48 因子縱向監測，再到流式驗證，這項研究幾乎涵蓋了目前常見的多技術串聯思路。
01：整體設計思路：一套樣本，五層解析
研究以腦脊液 (CSF)、外周血和骨髓為核心樣本體系，建立了多層解析鏈條：
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層級 |
技術 |
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單細胞轉錄組測序 (scRNA-seq) |
描繪 CAR-T 及免疫細胞群體結構 |
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CITE-seq (轉錄+蛋白組) |
融合表型與信號，提升注釋精度 |
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單細免疫組庫測序（scVDJ-seq） |
追蹤T/B細胞克隆擴增與衰竭狀態 |
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單細胞染色質可及性測序（scATAC-seq） |
解析轉錄因子調控與染色質可及性 |
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Luminex 48-plex 多因子檢測 |
定量解析多維免疫信號變化 |
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流式/成像流式 |
直觀驗證 CAR-T 與 CD138⁺漿細胞相互作用 |
所有 scRNA/CITE/VDJ/ATAC 測序均涵蓋 CSF 樣本，與 Luminex 的 CSF 檢測完全呼應，形成了“同源樣本、不同維度”的閉環。
02：多因子檢測：縱向量化炎癥“溫度計”研究使用 Bio-Plex Pro Human Cytokine 48-Plex Kit，在 CSF 中追蹤 48 個炎癥與免疫調節因子。
結果顯示：治療后多項 IFN-γ、TNF-α、IL-1β 等促炎因子下降（下圖），炎癥譜整體“降溫”。這一趨勢與 scRNA-seq 揭示的髓系通路抑制 (下圖) 及 scATAC-seq 顯示的炎癥相關轉錄因子活性降低相一致。
同一樣本，微量 CSF 即可完成48個指標的并行檢測——這是 Luminex 在臨床研究階段極具優勢的部分。
Luminex檢測不同時間點腦脊液中的細胞因子變化
scRNA-seq 揭示的髓系細胞炎癥通路下調
03：單細胞組學：解釋“誰”在驅動炎癥變化單細胞測序揭示治療前后 CAR-T、B、T、髓系細胞的比例和轉錄狀態變化。
其中B細胞/漿細胞軸顯著下降，對應 CSF 游離 κ 輕鏈 (KFLC) 水平下降（下圖G）；同時單細胞分析 (下圖H–I) 顯示 CAR-T 在 CSF 中持續存在并保持活化表型。這部分解釋了 Luminex 讀數中炎癥因子下降的來源—是CAR-T 清除了高分泌漿細胞與活化的髓系細胞。
研究通過 Imaging Flow 顯示 CAR-T 細胞與 CD138⁺漿細胞直接接觸，提示二者可能形成細胞-細胞免疫識別界面（下圖）。同時結合常規流式分析B、T、NK亞群動態，進一步驗證 CAR-T 在外周及 CNS 內的活性。這一部分是將多組學推論“落地成像”的關鍵環節，也是整篇研究中視覺沖擊力最強的一環。
05：多技術協同的科研啟發
單細胞告訴你“誰在說話”，Luminex 告訴你“說了什么”，流式告訴你“它真的行動了”。這篇 Cell 工作的最大亮點，不只是證明CAR-T療效，更是展示了多技術串聯的科研設計力：同一患者、同一樣本體系下，單細胞定義細胞圖譜與通路；流式驗證細胞表型； Luminex 多因子定量縱向變化。這種“多維合一”的思路，為CNS疾病、免疫治療、細胞療法等研究提供了可直接復用的方案模板。
06：Labex 提供完整的“多技術協同檢測鏈”：
單細胞平臺（scRNA/CITE/VDJ/ATAC）；流式 + 流式分析；Luminex 48 因子檢測（血清/血漿/細胞上清/腦脊液/組織裂解液/細胞裂解液/肺泡灌洗液等等）；助力研究者從表型、功能、機制到療效一站式解析免疫調控。
