利用密度梯度離心分離循環(huán)腫瘤細(xì)胞的方法及步驟
瀏覽次數(shù):549 發(fā)布日期:2025-9-4
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今天為大家介紹使用密度梯度離心的方法(Ficoll,Percoll)分離循環(huán)腫瘤細(xì)胞(CTC)的策略。
循環(huán)腫瘤細(xì)胞CTCs簡(jiǎn)介
1869年,Ashworth,T.R等【1】首次在一例轉(zhuǎn)移性腫瘤患者血液中觀察到循環(huán)腫瘤細(xì)胞(Circulating Tumor Cells, CTCs)。CTCs即是指從原發(fā)腫瘤或轉(zhuǎn)移灶脫落,進(jìn)入血液循環(huán)系統(tǒng)的腫瘤細(xì)胞【2】,如圖1。
圖1:循環(huán)腫瘤細(xì)胞CTCs進(jìn)入血液循環(huán)
原發(fā)腫瘤釋放CTCs進(jìn)入循環(huán)中,大部分CTCs死亡,但是少部分CTCs存活并在遠(yuǎn)端形成轉(zhuǎn)移灶【9】。
每天每g原位瘤可能會(huì)釋放多達(dá)百萬(wàn)的腫瘤細(xì)胞進(jìn)入血液循環(huán)【3】,但大部分因血流剪切力、失巢凋亡、免疫系統(tǒng)識(shí)別【4】而被清除,只有極少數(shù)(0.01%)【4】【5】存活下來(lái),通過(guò)血液或淋巴到達(dá)遠(yuǎn)端器官形成新的轉(zhuǎn)移灶,是腫瘤轉(zhuǎn)移(Metastasis)和復(fù)發(fā)的重要生物學(xué)基礎(chǔ)之一。
因此,CTCs是腫瘤精準(zhǔn)醫(yī)療的重要靶點(diǎn)【6】,作為液體活檢(其它如cfDNA、cfRNA、microRNA、外泌體、腫瘤代謝物)重要組成之一,其完整細(xì)胞的特有屬性,允許通過(guò)表型、基因型(如單細(xì)胞測(cè)序)、細(xì)胞功能以及異種移植模型,用于腫瘤早期診斷、疾病進(jìn)展、復(fù)發(fā)檢測(cè)、轉(zhuǎn)移癌監(jiān)控、腫瘤亞型改變、耐藥性研究以及預(yù)后評(píng)估【7】,促進(jìn)個(gè)體化治療實(shí)施。
此外,CTCs攜帶了腫瘤的基因組、轉(zhuǎn)錄組和代謝組等多組學(xué)信息,可用于研究腫瘤微環(huán)境、轉(zhuǎn)移微環(huán)境PMN、免疫逃逸機(jī)制,還可用于培養(yǎng)類器官【8】進(jìn)行體外藥物篩選和檢測(cè)。
CTCs的分離方法
CTCs的分離方法,主要分為非標(biāo)記法和標(biāo)記法,如圖2。
圖2:CTCs分離、培養(yǎng)和分析方法【10】
非標(biāo)記法
主要依賴CTCs自身的物理性質(zhì),如大小、密度、粘附、介電性質(zhì)和變形性【11】【12】。被廣泛使用的Cytiva Ficoll-Paque 和Percoll分離液即基于密度分離。大小和變形性等則常用于微流控技術(shù)【13】。
標(biāo)記法
主要為陽(yáng)性富集(如上皮細(xì)胞粘附分子EpCAM【14】、HER2、束絲蛋白3【15】、前列腺特異性抗原PSA【16】等或Cocktail)和陰性富集(如CD45抗體去除白細(xì)胞、CD61去除血小板和巨核細(xì)胞【17】、CD14等或Cocktail)。
基于抗EpCAM免疫磁珠技術(shù)的CellSearch CTC Test方法,是目前唯一被美國(guó)FDA批準(zhǔn)作為腫瘤預(yù)后評(píng)估工具用于轉(zhuǎn)移性乳腺癌(2004年)【18】、結(jié)直腸癌(2007年)【19】和前列腺癌(2008年)【20】。
中國(guó)CFDA在2012年批準(zhǔn)了CellSearch系統(tǒng)用于轉(zhuǎn)移性乳腺癌的預(yù)后評(píng)估。其它本土獲批產(chǎn)品包括CytoSorter循環(huán)腫瘤細(xì)胞檢測(cè)系統(tǒng)等,更多檢測(cè)方法也在興起和驗(yàn)證中。
CTCs的分離也可以聯(lián)合非標(biāo)記和標(biāo)記法【21】,并受到腫瘤類型的影響【17】。
但是,CTCs分離仍面臨挑戰(zhàn):
腫瘤細(xì)胞本身即具有異質(zhì)性。并且,CTCs因上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化(Epithelial-Mesenchymal Transition, EMT)失去極性和黏附性,獲得更強(qiáng)的遷移和侵襲能力,與基質(zhì)互作并抵抗治療,同時(shí)表現(xiàn)出上皮和間質(zhì)表型【22】,也造成細(xì)胞表面Marker的動(dòng)態(tài)變化。此外,CTCs還會(huì)和血液中其它細(xì)胞如白細(xì)胞形成CTC微血栓促進(jìn)自身生存和轉(zhuǎn)移。
CTCs在血液中的密度很低,~1-10 CTCs/mL血液【10】,分離富集挑戰(zhàn)大。一般,轉(zhuǎn)移性癌癥中每10 mL血液中有0-100個(gè)單體CTCs以及0-5個(gè)CTCs Cluster(CTCs簇),并與癌癥類型、血液收集位置以及治療階段有關(guān)【23】。CTCs半衰期通常只有 1.0‑2.4 h【24】。
使用密度梯度離心法分離CTCs
早在1959年,Seal SH等【25】即使用硅油配制密度梯度離心介質(zhì),分離血液中的游離腫瘤細(xì)胞。
目前,商品化的梯度介質(zhì),如Cytiva的Ficoll-Paque進(jìn)行CTCs的分離,在臨床研究中被廣泛使用【21】【26】【27】【28】。
作為非標(biāo)記的分離方法,利于富集表面Marker表達(dá)異質(zhì)性CTCs以及未知CTCs亞型,操作簡(jiǎn)單、低成本、快速,處理通量大。
使用密度梯度介質(zhì)分離CTCs,文獻(xiàn)報(bào)道中主要包括4種方法:常規(guī)標(biāo)準(zhǔn)操作、抗體預(yù)先結(jié)合雜質(zhì)細(xì)胞、抗體預(yù)先結(jié)合CTCs目的細(xì)胞,以及使用Percoll不連續(xù)密度梯度進(jìn)行分離。
使用Ficoll-Paque進(jìn)行CTCs分離的常規(guī)操作
根據(jù)斯托克斯定律,如圖3,顆粒的沉降速率v,和顆粒直徑(d)、樣品密度(ρp)和溶液密度(ρl)之差成正比;與溶液的粘稠度(η)成反比。當(dāng)不同細(xì)胞經(jīng)過(guò)同一密度離心介質(zhì),不同顆粒直徑和密度的細(xì)胞,沉降速率不同,從而被分開。
外周血中,紅細(xì)胞、粒細(xì)胞密度大【38】如圖6,穿過(guò)Ficoll-Paque密度梯度介質(zhì)(1.077 g/mL)沉于底層;外周血單個(gè)核細(xì)胞PBMCs和CTCs密度小,一起停留在白膜層(buffy coat)中,最上面是血漿。
后續(xù)可以使用陽(yáng)性富集【29】或陰性富集(如anti-CD45磁珠去除白細(xì)胞)【30】【39】進(jìn)一步回收CTCs。
圖3:顆粒沉降速率公式【31】
抗體結(jié)合雜質(zhì)細(xì)胞后,再使用密度梯度介質(zhì)分離CTCs
在密度梯度分離之前,進(jìn)行雜質(zhì)細(xì)胞預(yù)標(biāo)記,促進(jìn)其沉降。例如采用anti-CD45(白細(xì)胞共同抗原)【8】【32】【33】、anti-66b(粒細(xì)胞)與樣品進(jìn)行孵育,使白細(xì)胞與紅細(xì)胞形成免疫玫瑰花狀結(jié)構(gòu),密度和大小增加,在后續(xù)密度梯度離心過(guò)程中,將白細(xì)胞群拉到管底,則在白膜層可以回收更純的CTCs,如圖4,少量CTCs可能會(huì)滲漏到血漿層,也可以一起回收【6】【32】。
相對(duì)于陽(yáng)性篩選,基于去除白細(xì)胞的陰性篩選更有優(yōu)勢(shì),避免了使用抗體激活CTCs以及某些CTCs因?yàn)椴槐磉_(dá)相應(yīng)的抗原而被遺漏【32】。
圖4:使用Ficoll-Paque 密度梯度介質(zhì),分離CTCs
將血液和白細(xì)胞抗體如RosetteSep抗體孵育,使用DPBS+2% FBS稀釋血樣,然后小心地鋪到Ficoll-Paque 密度梯度介質(zhì)上面,離心(關(guān)閉剎車)后在白膜層收獲CTCs【32】。
抗體結(jié)合目的CTCs后,再使用密度梯度介質(zhì)分離CTCs
在密度梯度分離之前,進(jìn)行CTCs目的細(xì)胞預(yù)標(biāo)記,促進(jìn)其沉降。
Huang Q等【34】使用同時(shí)偶聯(lián)anti‑EpCAM抗體和anti‑CD146抗體(后者作為腫瘤標(biāo)志物以及上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化EMT誘導(dǎo)劑,利于捕獲EpCAM無(wú)/低表達(dá)間質(zhì)CTCs)的SiO2微珠(表面包被可降解明膠),先和血樣孵育以結(jié)合CTCs,之后將樣品鋪在Cytiva Percoll密度梯度介質(zhì)(配制成1.15 g/mL)的表面,離心,CTCs結(jié)合在微珠表面而沉降于管底,之后酶解表層明膠釋放CTCs,結(jié)果顯示CTCs收率>80%,純度大于85%,如圖5。
也可以使用Ficoll-Paque密度梯度介質(zhì),采用類似方法離心沉降CTCs目的細(xì)胞,收集管底組分并裂紅,回收CTCs。
圖5:基于微珠和密度梯度介質(zhì)進(jìn)行CTCs分離(部分圖片)
A:通過(guò)可降解明膠包被的微珠(偶聯(lián)了anti-EpCAM和anti-CD146抗體),高效吸附CTCs。
B:經(jīng)過(guò)Percoll密度梯度離心,將結(jié)合CTCs的二氧化硅微珠沉淀到管底,從而和血細(xì)胞分離。
C:通過(guò)基質(zhì)金屬蛋白酶MMP-9酶解明膠,釋放結(jié)合在微珠表面的CTCs。
除了CTCs單細(xì)胞外,CTC Cluster【35】以及CTCs與其它血液成分組成的細(xì)胞團(tuán),往往具有更高的轉(zhuǎn)移潛能。由于細(xì)胞團(tuán)的密度更大,容易在離心后沉降,也可以采用類似方法進(jìn)行分離,或使用Cluster-Chip【36】。
另外,具有干性的CTCs,即循環(huán)癌干細(xì)胞(Circulating Cancer Stem Cells,CCSCs)同樣值得關(guān)注。
細(xì)胞分離液產(chǎn)品是經(jīng)典的無(wú)菌即開即用型密度梯度介質(zhì),可以根據(jù)細(xì)胞密度的不同從樣品中分離出目標(biāo)細(xì)胞,具有高活性,高純度,高回收率等特點(diǎn)。
Ficoll Premium系列三款產(chǎn)品
Ficoll產(chǎn)品可以分為Ficoll-Paque Plus和Ficoll-Paque Premium兩大系列,Premium系列是在嚴(yán)格控制的環(huán)境下生產(chǎn)的(符合ISO 13485:2003,依從美國(guó)藥典章節(jié)<1043>的相關(guān)規(guī)定,具有法規(guī)支持文件 (RSF)),因此推薦可用作臨床研究和細(xì)胞治療,其成分與Ficoll-Paque plus沒有區(qū)別。
此外,F(xiàn)icoll-Paque premium產(chǎn)品具有1.077,1.084和1.073三種密度,為客戶提供更多的密度選擇。具體密度適用范圍參照下表:
產(chǎn)品選擇指南:
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貨號(hào)
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品名
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規(guī)格
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適用細(xì)胞類型
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17144002
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FICOLL PAQUE PLUS 1.077
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6X100ML
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人外周血,臍帶血,骨髓等樣品中分離單個(gè)核細(xì)胞
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17144003
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FICOLL PAQUE PLUS 1.077
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6X500ML
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17544202
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FICOLL PAQUE PREMIUM 1.077
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6X100ML
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17544203
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FICOLL PAQUE PREMIUM 1.077
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6X500ML
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17544602
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Ficoll-Paque PREMIUM 1.084
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6X100ML
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大/小鼠血液,骨髓,組織中分離單個(gè)核細(xì)胞。
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17544652
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Ficoll-Paque PREMIUM 1.073
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6X100ML
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分離人低密度細(xì)胞,如基質(zhì)細(xì)胞,間充質(zhì)干細(xì)胞。
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17089102
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PERCOLL
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250ML
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通用細(xì)胞分離,可稀釋成不同密度,可用來(lái)分離各種細(xì)胞及細(xì)胞器。如:中性粒細(xì)胞,單核細(xì)胞,腫瘤浸潤(rùn)淋巴細(xì)胞,巨噬細(xì)胞,病毒等等。
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17089109
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PERCOLL
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6X1L
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17089109-1
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PERCOLL
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1L
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17544502
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Percol1 PLUS 250 ML
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250ML
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17544501
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PERCOLL PLUS
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1L
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