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          RPA(恒溫?cái)U(kuò)增)技術(shù)應(yīng)用于腫瘤基因檢測(cè)

          瀏覽次數(shù):2413 發(fā)布日期:2024-5-16  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)
          腫瘤基因相關(guān)基因檢測(cè)在癌癥早期診斷中意義重大。目前的檢測(cè)金標(biāo)準(zhǔn)為PCR和基因測(cè)序技術(shù),而這些技術(shù)大多需要精密的儀器和復(fù)雜的試驗(yàn)流程,專業(yè)的實(shí)驗(yàn)人員配置。在現(xiàn)有的分子診斷技術(shù)中,以RPA為代表的核酸等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)以其快速,靈敏,無(wú)需儀器等特點(diǎn),使突破以上壁壘成為可能。
           
          近日,大連醫(yī)科大學(xué)劉元斌課題組發(fā)明一種無(wú)需任何儀器,實(shí)現(xiàn)快速檢測(cè)突變基因并肉眼識(shí)別的新方法,被稱為AS-RPA-PNA-SYBR (ARPS) system。該方法以RPA(重組酶聚合酶恒溫?cái)U(kuò)增技術(shù))為基礎(chǔ),加之PNA技術(shù)(肽核酸類似物),并利用SYBR Green I核酸染料法顯色,肉眼即可判斷核酸擴(kuò)增與否。
          文章中,作者比較了在PCR,測(cè)序以及ARSP在非小細(xì)胞肺癌中EGFR突變檢測(cè)應(yīng)用,發(fā)現(xiàn)在非小細(xì)胞肺癌細(xì)胞系中,5分鐘便能檢測(cè)到EGFR 19Del(2)缺失突變,10分鐘檢測(cè)EGFRL SNP 突變,實(shí)現(xiàn)肉眼快速判斷(圖1),并在組織樣本中同樣得到驗(yàn)證(圖2)。

          同樣,10到20分鐘之內(nèi)成功檢測(cè)到EGFR點(diǎn)突變。與傳統(tǒng)的DNA測(cè)序方法相比較,ARPS有著許多優(yōu)勢(shì)之處,包括時(shí)間短,成本低,操作簡(jiǎn)單,無(wú)需精密儀器等,而且,在基因組DNA樣本中,ARPS可以檢測(cè)到30%和40%的靶向突變位點(diǎn),靈敏度與測(cè)序相當(dāng)(圖3)。之前有文章報(bào)道稱,RPA技術(shù)與末端熒光檢測(cè)和膠體金側(cè)流試紙條以及微流控芯片結(jié)合檢測(cè)EGFR突變,但還沒有類似ARSP肉眼觀測(cè)法的應(yīng)用。

          然而,ARSP法同樣有待于進(jìn)一步優(yōu)化。比如,對(duì)于每一次EGFR檢測(cè)來說,檢測(cè)靈敏性和特異性都還有待提高;由于樣本量有限,現(xiàn)仍需更多的臨床樣本實(shí)驗(yàn)進(jìn)行驗(yàn)證。無(wú)論如何,在精準(zhǔn)醫(yī)療大背景下,對(duì)于一些沒有條件購(gòu)買測(cè)序儀,以及不具備專業(yè)操作能力的不發(fā)達(dá)地區(qū)和國(guó)家,這種快速簡(jiǎn)便,操作簡(jiǎn)單的,無(wú)需任何儀器的ARSP基因檢測(cè)法無(wú)疑為癌癥基因檢測(cè)提供有效參考,同時(shí)也為分子即時(shí)診斷領(lǐng)域(POCT)提供新的潛在解決方案。

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