Millipore試劑盒推薦使用Q800R3設備剪切染色質

染色質通常被認為是由DNA、組蛋白和非組蛋白組成的復合體。RNA染色質復合體的成分被認為是由mRNA或傳統的snRNA組成，它在轉錄過程中短暫地與染色質相關聯。然而，越來越多的證據表明各種類型的非編碼RNA（例如：長鏈非編碼RNA，增強子RNA，甚至miRNA）與染色質結合并可能通過序列特異性雜交和/或通過結構和空間機制來實現調節功能。為了更好地描述這些調控機制，需要一種方法來識別和描述RNA分子（包括編碼和非編碼）、蛋白質和DNA之間的相互作用。
 
Magna ChIRP^TM（點擊下載說明書）是由Millipore（默克-密理博）推出的用于研究和lncRNA（長鏈非編碼RNA）相互作用的染色質DNA序列及蛋白的商品化試劑盒。這個試劑盒采用了獨特的方法，可以發現染色質關聯RNA（如lncRNA）與基因組DNA序列的結合位點，也可用于lncRNA調節復合體的蛋白質組分進行蛋白組學分析。
 
染色質或染色質RNA復合體的研究離不開超聲波剪切儀。Millipore（默克-密理博）在ChIRP^TM使用手冊里推薦用Qsonica的Q800R3染色質/DNA剪切超聲波破碎儀來完成染色質的修剪。
 

Kit說明書內頁截圖：

 
Magna ChIRP^TM基本原理如下圖：