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蛋白質(zhì)藥物的圓二色譜分析技術(shù)服務(wù)
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——即蛋白質(zhì)藥物的圓二色譜分析技術(shù)服務(wù)
目前研究蛋白質(zhì)、多肽的二級(jí)及高級(jí)結(jié)構(gòu)的方法有幾種,如X-ray晶體衍射技術(shù)、核磁共振技術(shù)和圓二色譜技術(shù)等。前兩種方法較復(fù)雜,并且受很多因素影響,分析起來(lái)比較困難。相對(duì)而言,圓二色譜是一種比較簡(jiǎn)單且有效的技術(shù),也是目前研究蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)的主要手段之一。
圓二色譜儀的工作原理是:利用蛋白質(zhì)的圓二色性及不對(duì)稱分子對(duì)左右圓偏振光吸收的不同來(lái)進(jìn)行結(jié)構(gòu)分析。蛋白質(zhì)或多肽中主要的光活性基團(tuán)是肽鍵、芳香氨基酸殘基及二硫鍵等,當(dāng)平面圓偏振光的吸收不相同時(shí),會(huì)產(chǎn)生吸收差值。由于這種吸收差的存在,造成了偏振光矢量的振幅差,圓偏振光變成了橢圓偏振光,即蛋白質(zhì)的圓二色性。通過(guò)圓二色譜掃描儀,可以在一定程度上分析蛋白質(zhì)、多肽樣品的二級(jí)結(jié)構(gòu)和高級(jí)結(jié)構(gòu)。

“蛋白質(zhì)多肽的圓二色譜分析對(duì)于研究二級(jí)和高級(jí)結(jié)構(gòu)非常有意義”
技術(shù)指標(biāo)
圓二色譜分析的供試品,大多數(shù)情況下的蛋白質(zhì)和多肽。蛋白質(zhì)的精確濃度是計(jì)算樣品二級(jí)結(jié)構(gòu)的關(guān)鍵,一般要求樣品濃度為0.2μg/μl,濃度過(guò)高,測(cè)試時(shí)信號(hào)不好,需稀釋,樣品純度要在90%以上,不要添加任何保護(hù)劑或其它物質(zhì),樣品中應(yīng)避免含有光吸收的雜質(zhì),緩沖劑和溶劑在配制溶液前最好做單獨(dú)的檢查,透明性極好的磷酸鹽可用作緩沖體系。
圓二色譜在遠(yuǎn)紫外區(qū)的掃描圖譜,反映的是蛋白質(zhì)肽鍵的排布信息,計(jì)算所得的是蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)比例,即α-螺旋、β-折疊、轉(zhuǎn)角和不規(guī)則卷曲的比例。
圓二色譜在近紫外區(qū)的掃描圖譜,反映的是蛋白質(zhì)側(cè)鏈生色基團(tuán)色氨酸、苯丙氨酸、酪氨酸等殘基的排布信息和二硫鍵微環(huán)境的變化。
案例分析
下圖分別為蛋白質(zhì)樣品和其對(duì)照品在遠(yuǎn)紫外區(qū)和近紫外區(qū)的Overlay圖。

圖為蛋白類供試品的遠(yuǎn)紫外Overlay圖譜(藍(lán)色代表樣品,綠色代表對(duì)照品)

圖為蛋白類供試品的近紫外Overlay圖譜(藍(lán)色代表樣品,綠色代表對(duì)照品)
樣品及其對(duì)照品的二級(jí)結(jié)構(gòu)含量分析結(jié)果如下圖,兩者的二級(jí)結(jié)構(gòu)含量相似。

結(jié)果:樣品和對(duì)照品的遠(yuǎn)、近紫外區(qū)的圓二色譜圖,經(jīng)Overlay處理后圖譜基本重疊;遠(yuǎn)紫外區(qū)的圓二色譜圖經(jīng)過(guò)分析二級(jí)結(jié)構(gòu)后,各種二級(jí)結(jié)構(gòu)含量也基本一致,說(shuō)明樣品和對(duì)照品具有一致的二級(jí)結(jié)構(gòu)和空間結(jié)構(gòu)。
Q&A
1) 圓二色譜的解讀。
圓二色譜技術(shù)能快速、簡(jiǎn)單、較準(zhǔn)確地研究溶液中蛋白質(zhì)和多肽的構(gòu)象,并且運(yùn)用斷流、電化學(xué)等附加裝置,結(jié)合溫度、時(shí)間等變化參數(shù),已經(jīng)廣泛用于了解蛋白質(zhì)-配體的相互作用,監(jiān)測(cè)蛋白質(zhì)分子在外界條件誘導(dǎo)下發(fā)生的構(gòu)象變化,探討蛋白質(zhì)折疊、失活過(guò)程中的熱力學(xué)與動(dòng)力學(xué)等多方面的研究。
2) 圓二色譜分析的軟件介紹。
圓二色譜在遠(yuǎn)紫外區(qū)的掃描圖譜,反映的是蛋白質(zhì)肽鍵的排布信息,計(jì)算所得的是蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)比例;圓二色譜在近紫外區(qū)的掃描圖譜,反映的是蛋白質(zhì)側(cè)鏈生色基團(tuán)色氨酸、苯丙氨酸、酪氨酸等殘基的排布信息和二硫鍵微環(huán)境的變化。
目前用于拆分和估算的軟件不下十幾種,得到研究者廣泛認(rèn)同的計(jì)算模式有幾種,但由于不同計(jì)算模式的理論基礎(chǔ)不同,所計(jì)算得到的蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)比例并不完全相同,但多數(shù)軟件對(duì)α-螺旋的估計(jì)還是比較準(zhǔn)確的。APT采用JWSSE32軟件對(duì)樣品和對(duì)照品的二級(jí)結(jié)構(gòu)進(jìn)行擬合計(jì)算,參考標(biāo)準(zhǔn)曲線采用軟件自帶的標(biāo)準(zhǔn)α-螺旋(α-helix)、β-折疊(beta-pleated sheet)、轉(zhuǎn)角(turn)和不規(guī)則卷曲(random coil)曲線。由于本預(yù)測(cè)結(jié)構(gòu)可能存在誤差,僅供參考之用。