首期“單細胞空間組學應用科學沙龍”圓滿結束

（一）單細胞空間組學的發展

    生命科學的發展離不開技術的推動。從單細胞測序技術被《Nature Methods》評為2013年度技術，到空間轉錄組學在2020年獲得年度技術的殊榮，并被認為將對細胞生物學、病理學和組織學的研究帶來深遠影響，再到空間蛋白組學剛剛進入科學視野，這些技術的進步正在不斷開拓新的研究領域。許多研究者已經或正準備利用這些前沿技術來開展研究，但在技術平臺的選擇、研究方法的應用、以及數據挖掘，多平臺整合等方面，仍有不少值得進一步探討的空間。

    為此，森西賽智與iFuture科學咖于2024年9月5日舉辦了首期“單細胞空間組學應用科學沙龍”。我們非常榮幸地邀請到在這一領域具有豐富經驗的海內外專家們，來分享他們的研究經驗，并共同探討如何利用這些新興技術推動科學研究的進展。本次沙龍采用線上與線下結合的形式舉行，誠摯邀請身處上海及周邊的老師們親臨iFuture科學咖徐匯現場，與我們一同參與這場學術交流。通過此次機會，我們與科研工作者們共同探索單細胞空間組學的廣闊前景。

圖1. “單細胞空間組學應用科學沙龍”簡介。
 

（二）陳云舜教授報告

    我們首先邀請澳大利亞沃爾特和伊麗莎白·霍爾醫學研究院（WEHI）的陳云舜教授（Dr.Yunshun Chen)做題為“Exploring human breast cancer tissues with Vizgen MERSCOPE”的報告。陳教授分享了其在人類乳腺癌腫瘤微環境生信解析中大量利用Vizgen MERSCOPE®系統研究空間轉錄組的案例，基于MERSCOPE®開發了一系列的空間組學解析工具（研究細胞種類、細胞種類密度、腫瘤細胞微環境、腫瘤細胞分化等），說明Vizgen MERSCOPE®系統可以以亞細胞的分辨率分析FFPE組織樣本，其下游生信分析可提供豐富的、多角度的統計學分析數據研究腫瘤微環境。

圖2. 陳云舜教授簡介。

圖3.陳云舜教授的報告題目。

圖4. 陳教授回答提問。
 

（三）張曉亮先生報告

    然后Vizgen中國區總經理張曉亮先生做題為“超高分辨原位成像法空間轉錄組研究新維度——Vizgen MERSCOPE/MERFISH研究進展”的報告。張曉亮先生詳細介紹了Vizgen MERSCOPE®系統的原理、特點、優勢和在空間轉錄組研究中的應用，凸顯了其基于MERFISH（抗誤差多重熒光原位雜交）技術和超高分辨成像技術，可在亞細胞分辨率下實現大規模多重、基因組規模的核酸與蛋白分子成像的能力，具有高精度和無與倫比的檢測效率。MERSCOPE在腫瘤學、免疫學、神經科學、傳染病、發育生物學、植物學、農業、細胞和基因治療等多個領域都有廣泛的應用實例，為基于全組織的基礎研究和轉化醫學提供變革性的見解，是加速藥物發現和開發的重要工具。并介紹了超過10000個基因的基因組原位成像和第一個利用MERFISH技術進行斑馬魚全胚胎三維空間轉錄組成像、空間轉錄組在免疫治療臨床研究中的重要進展等發展趨勢和最新成果，截至2024年8月底，應用Vizgen技術的高質量研究文獻發表超過240篇，其中不含預印本的正式發表期刊中CNS正刊超過30篇，含子刊超過70篇，75%影響因子為10分以上。

圖5. 張曉亮先生簡介。

圖6.張曉亮先生的報告題目。

圖7. 張曉亮先生介紹Vizgen MERSCOPE®系統。
 

（四）田瑞軍教授報告

    我們也榮幸地邀請到南方科技大學田瑞軍教授在線對他的工作“單細胞分辨率空間可視化蛋白質組學技術應用于解析胰腺癌腫瘤微環境”進行了經驗分享。

圖8. 田瑞軍教授簡介。

圖9. 田瑞軍教授的報告題目。
 

（五）薛瑞棟教授報告

    北京大學醫學部薛瑞棟教授最后做了題為“空間單細胞解析腫瘤克隆演化與微環境”的報告。薛教授分享了在肝癌細胞的腫瘤間異質性（分子亞型、診斷標志物）、腫瘤內異質性（腫瘤進化樹和雙相演化模型）和細胞異質性（TIME亞型、嗜中性粒細胞異質性）研究中的工作，也凸顯了空間轉錄組分析在肝癌細胞異質性研究中的重要作用。

圖10. 薛瑞棟教授簡介。

圖11. 薛瑞棟教授的報告題目。

圖12.薛瑞棟教授回答提問。

    沙龍的線上直播也吸引了近2000人在線觀看，各位老師、科研工作者熱烈參加討論，進一步探討單細胞空間組學在腫瘤學、免疫學、神經科學等領域的廣闊應用前景。現場活動在22:00落下帷幕，我們期待在下一期“單細胞空間組學應用科學沙龍”中再次相聚，給各位科研工作者帶來更多、更精彩的學術盛宴！

（六）附錄

6.1關于MERFISH與MERSCOPE^®  

    MERFISH（multiplexed error-robust fluorescence in situ hybridization，抗誤差多重熒光原位雜交）技術通過使用組合標記、順序成像和糾錯條形碼方案來擴展單分子FISH（smFISH）的功能，以納米精度檢測RNA。這為研究人員開啟了了解每個細胞內轉錄組組成與分布的窗口。MERFISH技術由哈佛大學莊小威教授團隊開發并于2015年首次發表，此后已累計發表了200多篇經過同行評審的文章，每年都有更多令人興奮的發現。MERSCOPE™ “超高分辨單細胞原位空間組學分析系統”以革命性的MERFISH技術引領，探索超高分辨多重原位單細胞空間基因組學新維度，這是全球第一個結合單細胞和空間基因組學分析的超多重、超高分辨率原位單分子檢測分析平臺。將MERFISH技術的強大性能和潛力與高分辨率成像、流體學、圖像數據處理和自動化相結合，提供了一個端到端的解決方案，協助科學家極致探索空間生物學信息。通過空間基因組學技術，可以生成包括RNA表達、細胞類型、細胞狀態和組織物理結構的完整生物圖譜，為生物學提供了前所未有的理解深度，打開了生物技術下一個前沿的大門。

6.2 關于Vizgen^®       

    Vizgen致力于開拓下一代基因組學，提供展示原位單細胞空間基因組學廣闊潛能的工具。該公司在空間基因組學領域建立了基準，并持續推動行業創新，提供最高的靈敏度、出色的特異性以及高度精確的細胞分割。這些工具使研究人員能夠通過空間背景對調控人類健康和疾病的生物系統不斷獲得新的見解。Vizgen 的 MERSCOPE® 平臺可在亞細胞分辨率下實現大規模多重、基因組規模的核酸與蛋白分子成像，具有高精度和無與倫比的檢測效率。MERSCOPE為腫瘤學、免疫學、神經科學、傳染病、發育生物學、植物學、農業、細胞和基因治療等領域廣泛的基于全組織的基礎研究和轉化醫學提供了變革性的見解，是加速藥物發現和開發的重要工具。截止2024年3月，應用Vizgen技術發表的SCI文獻數目≥100篇且影響因子超20分的文獻數目≥30篇。有關詳細信息，請轉到 www.vizgen.com，郵箱china@vizgen.com。或在社交媒體Wechat，Twitter，LinkedIn和Facebook上關注并聯系我們。

6.3 關于森西賽智

     Vizgen的中國區戰略合作伙伴“森西賽智科技有限公司”將和Vizgen團隊攜手共同打造國內高水平單細胞原位空間組學分析技術和服務平臺。

     森西賽智（北京/上海/廣州/成都）擁有超過20年的生命科學和生物技術領域的自主研發和國際品牌代理經驗，專注于國內整合和推進全球產品進入中國的研發市場，產品線覆蓋分子、蛋白、細胞、組織、小動物、生物工藝和自動化等領域。森西賽智在全國各主要城市都有銷售或售后服務網點，相關工作人員均接受原廠培訓，具有雄厚的技術支持基礎，可以為客戶提供專業周到的服務。自成立以來，“森西賽智科技有限公司”已為5300+客戶提供優質的產品和服務。