液滴微流體助艾滋病毒感染-潛在文庫的轉(zhuǎn)錄組測序

DoBio Webinar：液滴微流體方法輔助完成艾滋病毒感染“潛在文庫”的轉(zhuǎn)錄組測序


 

Eli Boritz，醫(yī)學(xué)博士，

美國國立衛(wèi)生研究院(NIH)病毒持久性和動態(tài)科(VPDS)主任

我們很榮幸地請到Eli Boritz博士作為本次線上研討會的演講者。
 
Boritz博士和他的團(tuán)隊最近在《自然》雜志上發(fā)表了一篇論文，重點(diǎn)介紹了他們應(yīng)用一種基于RNA或DNA生物標(biāo)志物的新方法來分類和分析細(xì)胞類型亞群。研究小組使用這種方法研究了抗逆轉(zhuǎn)錄病毒治療下艾滋病毒持久性的機(jī)制，特別是艾滋病毒感染的記憶CD4 T細(xì)胞的表達(dá)譜。

該方法被稱為細(xì)胞水平的核酸檢測和測序分析(Focused Interrogation of cells by Nucleic acid Detection and Sequencing , FIND-seq)，包括通過目標(biāo)核酸(本研究中的HIV)識別細(xì)胞，并將其分類用于單細(xì)胞級別的轉(zhuǎn)錄組分析。研究人員利用微流體技術(shù)制備瓊脂糖凝膠珠包封單個細(xì)胞的遺傳物質(zhì)，并根據(jù)HIV核酸標(biāo)記物的熒光信號對瓊脂糖珠進(jìn)行分類。細(xì)胞的整個轉(zhuǎn)錄組被保留在瓊脂糖珠內(nèi)之后可以通過測序進(jìn)行進(jìn)一步分析。
研究結(jié)果表明，接受抗逆轉(zhuǎn)錄病毒治療的人的HIV DNA+記憶CD4 T細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄組顯示出一個特有的性質(zhì)，其宿主基因表達(dá)模式有利于HIV沉默、細(xì)胞存活和細(xì)胞增殖，這對HIV治愈策略的發(fā)展具有重要意義。

歡迎加入我們即將舉行的線上研討會，從Boritz博士那里了解更多關(guān)于FIND-seq以及艾滋病毒如何在抗逆轉(zhuǎn)錄病毒治療期間持續(xù)存在的最新進(jìn)展。

- 一種由RNA或DNA生物標(biāo)記物定義的RNA測序細(xì)胞亞群的新方法 
- FIND-seq在研究hiv感染記憶CD4 T細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組中的應(yīng)用 
- 抗逆轉(zhuǎn)錄病毒療法(ART)下艾滋病毒持續(xù)機(jī)制的發(fā)現(xiàn)

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