生物信息學最新技術暨解碼基因組原理與方法培訓通知

瀏覽次數：3484　發布日期：2016-11-9　來源：本站　本站原創，轉載請注明出處

關于舉辦“生物信息學最新技術暨解碼基因組功能原理與方法”

實操班通知

各有關單位:

隨著分子生物學技術和生物信息學的發展，功能基因組學的研究已成為基因組學中引人注目的新方向和研究熱點。利用結構基因組學提供的信息和產物，通過在基因組或系統水平上全面分析基因的功能，使生物學研究從單一基因或蛋白質的研究轉向對多個基因或蛋白質同時進行系統的研究。“智能信息處理技術”為人力資源與社會保障部中國科學院北京分院國家級專業技術人員繼續教育基地培訓點培訓項目，“生物信息”為智能信息處理技術系列培訓項目之一。為進一步推動我國生物信息學的發展，提高從業人員的技術水平，北京海淀中科計算技術轉移中心（中科院計算所技術轉移中心）舉辦“生物信息學最新技術暨解碼基因組功能原理與方法”高級培訓班，并由北京嘉誠永恒科技有限公司具體承辦，具體事宜通知如下：

一、培訓目標及特點：

培訓立足于最新技術和工具，強調融會貫通，強調綜合應用。采用“互動式教學、討論式授課、上機實操”等教學模式。培訓邀請的主講老師均是有理論和實際研究經驗的專家。學員通過與專家直接交流，能夠分享到頂尖學術機構的研究經驗和實驗設計思路。學員通過集中專題學習后能夠擴展思路，在研究技術方面領悟更多。

二、培訓對象：

大中專院校生物信息、生物計算、生命科學、醫學、化學、農學、計算機科學、數學類專業的課程負責人、一線教師、教研室骨干人員、教學管理人員；科研單位從事生物、生命科學、微生物研究的相關人員；生物、醫藥、化學及相關企業的領導與技術骨干。

三、時間地點：

2016年12月8日 — 11日上海

（時間安排：第1天報到，授課3天）

四：培訓內容

一、DNA測序技術-原理及技術	a)第二代測序技術：Illumina，454, Ion Torrent原理 b)第三代測序技術：PacBio, Hellicos原理 c)第四代測序技術：Oxford NanoPore原理 d)Hybridization based methods e)測序技術的比較及展望
二、基因組編輯技術（CRISPR技術）	1）基因編輯技術發展和CRISPR/Cas9技術基本原理 2）CRISPR技術用于基因敲除、敲入細胞株構建 3）CRISPR技術用于基因敲除、敲入小鼠構建 4）CRISPR技術用于大規模遺傳篩選 5）CRISPR技術用于體內基因編輯 6）CRISPR病毒運載系統介紹 7）CRISPR技術應用的其他最新進展
三、生物信息學基本實驗技能	a)Linux常用命令 b)EMBOSS，經典序列分析工具集 c)Perl編程基礎
四、小RNA(microRNA)研究方法及案例	a)實驗流程 b)數據處理比對 c)靶基因富集分析 d )miRNA-mRNA關聯分析 e)主要工具包的使用：miRDeep，mirDeep*
五、長非編碼RNA（lncRNA）研究方法及案例	a)實驗流程 b)lncRNA的發現和分類 c) 功能分類 d)主要工具包的使用：lncRScan，LncRNAFunction等
六、表觀遺傳學研究方法及案例	a )DNA methylation, MeDIP-seq b )Histone modifications, ChIP-seq, ChIP-exo c )Nucleosoem positioning and occupancy, MNase-seq d )Chromatin accessibility, DNase-seq e )3D chromatin structure, 3C, 4C, 5C, Hi-C
七、基于DNA/RNA測序技術的功能基因組學研究策略分析	a )ARNA Transcription: ChIRP-Seq, GRO-Seq, Ribo-Seq, CLIP-Seq b )RNA structure: SHAPE-Seq, PARS-Seq, FRAG-Seq, CAP-seq c )Low-level RNA detection: Quartz-Seq, DP-Seq, Smart-Seq, d d )Smart-Seq2 e )Low-level DNA detection: smMIP, MDA, MALBAC, OS-Seq