伯齊講座：NGS核酸片斷化、文庫構(gòu)建與捕獲自動化

瀏覽次數(shù)：3560　發(fā)布日期：2016-9-14　來源：本站　本站原創(chuàng)，轉(zhuǎn)載請注明出處

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背景內(nèi)容

隨著二代測序(NGS)技術(shù)的推廣和使用，測序分析向著高通量、低成本的方向發(fā)展。測序樣本在上機(jī)進(jìn)行測序之前，需要對測序樣本進(jìn)行前處理。前處理的整個過程涉及到核酸的提取和純化，核酸的定量，基因文庫的構(gòu)建，PCR擴(kuò)增，目的序列的捕獲等多個操作過程，過程十分繁瑣。因此，將樣本前處理的步驟最大程度的自動化和高通量化，減少人力的操作時間，有利于提高工作效率。

在開始測序前，樣本DNA需要進(jìn)行片段化處理，以符合測序儀可讀的片斷大小。伯齊科技引入了美國Microsonics系統(tǒng)，可以將DNA片段化工作高通量化，并且還可以選擇片段的大小，從而快速、精確的將樣本DNA片段化。其產(chǎn)生的片斷大小均一，更可省掉后續(xù)的片斷篩選步驟，簡化樣本處理程序。
片斷化之后便是測序文庫的構(gòu)建和捕獲，這也是測序樣本前處理的關(guān)鍵但也是最耗時的步驟。二代測序過程中的文庫構(gòu)建、序列捕獲和純化，涉及到試劑的配制、磁珠的吸附，磁珠的洗滌、純化等操作步驟，十分瑣碎且耗力。法國Primadiag（派瑪廸格）的全自動NGS樣本建庫捕獲系統(tǒng)，為二代測序過程中的文庫構(gòu)建、序列捕獲和純化提供自動化解決方案。該系統(tǒng)由于其高度的靈活性，可自動化完成包括試劑配制在內(nèi)的各種工作，真正實現(xiàn)測序樣本制備自動化。系統(tǒng)的智能計算功能，也使得建庫和捕獲所使用的實際試劑消耗達(dá)到最小，并且允許使用最少的槍頭數(shù)來完成整個工作，大大節(jié)約試劑和耗材成本。
這次公開課伯齊科技將向您介紹測序樣本前處理步驟及高通量的全自動NGS樣本建庫捕獲系統(tǒng)。
演講者信息劉祖梅 (Susie LIU) 香港伯齊科技有限公司 (技術(shù)支持) 醫(yī)學(xué)碩士，2008年畢業(yè)于華中科技大學(xué)。2008年至2015年先后于上海生命科學(xué)研究院和艾伯維醫(yī)藥從事于基礎(chǔ)科學(xué)研究和新藥的早期研發(fā)工作。2016年加入香港伯齊科技有限公司，主要職位為儀器應(yīng)用技術(shù)支持，在二代測序(NGS)自動化應(yīng)用上有很豐富的經(jīng)驗。

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