江蘇CDC利用MiSeq測序技術對H7N9研究獲重要進展

 

       記者近日獲悉，江蘇省疾病預防控制中心在H7N9流感病毒檢測和研究上取得兩項重大進展，研究成果分別發表在世界頂尖醫學學術期刊《新英格蘭醫學》《The New England Journal of Medicine》和《柳葉刀》（Lancet）上。

       自江蘇省報道第一例H7N9流感病毒感染者以來，大部分H7N9感染者都有禽類接觸史或去過畜禽交易市場，為此，南京市采取了暫停活禽交易的疾病預防控制措施，對全市的活禽進行檢查，可感染源并沒有找到，不僅僅在江蘇，感染源在哪，在全國范圍內目前均未有確定的說法。江蘇省疾病預防控制中心對第一例H7N9患者樣品及其工作的活禽屠宰場所臨近攤位的雞籠和二級活禽批發市場進行取樣，利用美國Illumina公司先進的全基因組測序儀MiSeq和熒光定量聚合酶鏈式反應法對樣品進行分析，發現患者樣品和環境樣品的H7N9流感病毒通過部分氨基酸的變化更加適應人類，進化樹分析表明這種新亞型H7N9流感病毒來源并不一致，在禽類中可能正在發生重組。溯源分析表明，新型H7N9流感病毒是從二級批發市場傳播到零售市場，進而傳染給人類，這也解釋了大部分H7N9感染患者有過禽類接觸史的流行病學調查資料，對于下一步的疾病預防控制工作非常重要。該研究成果發表在世界頂尖醫學學術期刊《新英格蘭醫學》上。

        在人類、禽類或其他動物中存在的多種病毒同時感染的現象也有可能是新型病毒的一個來源。江蘇省疾病預防控制中心對一例15歲H7N9患者的樣品進行新一代高通量并行測序分析后發現，有H7N9和H3N2兩種亞型的流感病毒同時感染了這名患者。雖然從2013年4月中旬后，H1N1亞型流感病毒已經取代H3N2亞型流感病毒作為在江蘇省流行的病毒亞型，但這次H7N9和H3N2共同感染同一個病人還是首次報道。而且，雙病毒感染是新型病毒重組亞型的一個潛在來源，人體很有可能是病毒重組的又一個混合容器。該研究充分利用MiSeq新一代測序技術的高通量并行測序優勢，通過幾步簡單的操作，在短時間內檢測到兩種流感病毒亞型同時感染，成果發表在頂級醫學雜志《柳葉刀》上，對于揭示是否會存在人際傳播以及加強病毒進化的監控非常重要。

        自發現首例H7N9患者以來，江蘇省衛生廳、疾病預防控制中心和各大醫院采取果斷措施，很快控制住疫情的進一步擴散，患者大部分都得到有效治療，治愈率高。江蘇省疾病預防控制中心利用最新的高通量測序技術對病毒樣品進行快速分析，研究成果高質量、快速度的發表在世界頂尖醫學學術雜志上，開創了江蘇省公共衛生和基礎研究的先例。