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          Chameleon全自動冷凍電鏡制樣系統助力解析 ABCC2 近原子分辨率

          瀏覽次數:180 發布日期:2025-11-13  來源:本站 僅供參考,謝絕轉載,否則責任自負

          在結構生物學領域,冷凍電鏡蛋白的高分辨率解析一直是 “硬骨頭”—— 這類蛋白易受制樣過程中的物理擾動、氣液界面效應影響,出現結構域解離、顆粒取向優勢,最終導致分辨率上不去、結構不完整。

          最近,國內冷凍電鏡服務領軍企業佰翱得(Biortus) 與英國 SPTLABTECH 的 Chameleon 全自動冷凍電鏡制樣系統聯手,以 ABCC2 蛋白(ABC 轉運蛋白 C 亞家族關鍵成員)為研究對象,交出了一份顛覆傳統制樣認知的 “成績單”:不僅實現了 ABCC2 蛋白 2.51Å 近原子分辨率完整結構解析,更驗證了 “全新的自動冷凍制樣” 模式在攻克難解析靶點時的核心優勢。

          背景
          ABC 轉運蛋白(ATP 結合盒轉運蛋白)是存在于所有生命形式中的一大類蛋白家族。它們是關鍵的分子機器,通過 ATP 水解供能,將多種底物跨細胞膜轉運。其功能對許多生命過程至關重要,包括營養物質攝取、毒素排出及細胞信號傳導等。

          典型的 ABC 轉運蛋白包含兩個核心功能結構域:

          • 跨膜結構域(TMDs):通常由 6-12 個跨膜 α- 螺旋組成,貫穿脂質膜,構成底物轉運通道,負責識別并結合特定轉運分子。

          核苷酸結合結構域(NBDs):負責結合并水解 ATP,水解反應釋放的能量驅動跨膜結構域發生構象變化,使轉運蛋白在向內開放和向外開放的構象間交替轉換,從而推動底物跨膜轉運。

          圖1  典型的 ABC 轉運蛋白示意圖

          傳統制樣的 挑戰:ABCC2 的 NBD 結構域為何“消失”?
          在冷凍電鏡解析中,“制樣” 是決定后續一切的基礎 —— 冰層質量、顆粒完整性、取向分布,直接影響最終重構結果。此前,常用的傳統濾紙吸附制樣技術,在 ABCC2 解析中暴露出明顯局限:

          圖2  傳統制樣ABCC2 WT的3.3 Å分辨率的二維分類和三維密度圖
          圖中紅色箭頭指示了缺失的NBD結構域位置,凸顯了結構的不完整性

          如圖2,傳統制樣時,濾紙與樣品直接接觸產生的機械剪切力、數秒級的氣液界面暴露時間,導致 ABCC2 的脆弱結構域(尤其是維持功能關鍵的雙 NBD 結構域)大量解離。從2D Class數據顯示,野生型 ABCC2 完整顆粒占比極低,突變體也僅有 20% 顆粒保留雙 NBD,其余 80% 均缺失一個 NBD;

          最終收集 96 萬 + 顆粒進行重構,樣品的最佳分辨率也僅能達到 2.8Å(且為缺失 NBD 的不完整結構),完整雙 NBD 結構的分辨率更是卡在 3.3Å,NBD 區域局部分辨率僅 4.0Å,無法滿足精細結構分析需求;緩慢的冷凍過程導致顆粒在冰層中取向集中,三維重構缺失關鍵角度信息,進一步限制分辨率提升。

          Chameleon×佰翱得:從 “破局” 到 “極致” 的技術支持
          面對 ABCC2 的解析難題,Chameleon 的 “黑科技” 制樣能力與佰翱得的全流程專業服務形成了完美互補,直接打破了傳統制樣的桎梏:

          作為 SPTLABTECH 推出的新一代全自動制樣系統,Chameleon 的核心優勢在于從原理上規避了傳統制樣的缺陷,為 ABCC2 提供了更完美的冷凍環境:

          • Blot-free 無濾紙設計:chameleon采用表面覆蓋納米纖維的自吸附載網,通過毛細作用自發吸附液體,完全避免濾紙與樣品的物理接觸,杜絕機械剪切力對 NBD 結構域的損傷;
          • 毫秒級極速冷凍:從噴射加樣(單次僅需 6nL 樣品,大幅降低珍貴樣品消耗)到冷凍完成,使用160~400 ms不等的時間,將氣液界面暴露時間壓縮至 “瞬間”,牢牢穩定 ABCC2 的完整構象;
          • AI 智能優化 + 全自動流程:內置高速攝像機實時監測液層吸附過程,AI 算法推薦最優制樣參數,不僅避免人為操作誤差,更能精準控制冰層厚度 —— 這為后續高分辨成像提供了的基礎。

          Chameleon制樣結果
           

          圖3 Chameleon制樣ABCC2的2D分類結果

          所有類別均清晰顯示完整的雙NBD結構

          Chameleon 制備的 ABCC2 樣品,完整雙 NBD 顆粒占比達到 100%,無論是 野生型還是突變型,均實現了結構完整性的 “零缺失”。

          Chameleon 制備高濃度樣品(5.5mg/mL)在獲得海量高質量顆粒(749,051個)的同時,仍能保持100%顆粒的完整性,從而將分辨率進一步提升至2.51 Å,充分證明了該技術在處理敏感蛋白時的可靠性。且顆粒取向分布均勻,徹底解決了傳統制樣的核心痛點。

          討論
          傳統制樣依賴濾紙物理blotting來去除多余液體,這個過程不僅耗時(通常數秒),使蛋白長時間暴露于氣液界面(AWI),而AWI是導致蛋白變性、解離或展開的主要元兇之一。同時,濾紙與樣品的直接接觸可能對脆弱的膜蛋白復合物(如ABCC2)產生機械剪切力,直接導致結構域(如NBD)的撕裂或損傷。

          而Chameleon采用超快速冷凍以及“Blot-free” 的樣品制備方式,它利用其專利的自吸附載網(表面覆蓋納米纖維),通過毛細作用自發吸附樣品液滴,完全避免了濾紙的物理接觸和擾動。同時更快的制樣速度有助于緩解取向優勢問題,促使顆粒以更隨機的方式被凍結,從而獲得更均勻的視角覆蓋,這為高分辨率重構提供了更完整的信息基礎。

          佰翱得
          佰翱得由“中國企業500強”雙良集團與多名擁有國際藥企工作經歷的海歸科學家聯合創立,致力于為全球創新藥物研發機構提供“以復雜蛋白制備為基礎,以結構生物學為核心,以冷凍電鏡為特色”的新藥早期研發服務,打造國際高端結構生物學領域領軍品牌。



          自2009年以來,佰翱得已與全球各領域的研究機構、生物技術公司和制藥公司建立了眾多合作關系,其業務遍布中國以及波士頓、舊金山、圣地亞哥、新澤西等生物醫藥企業聚集地。欲了解更多信息,請訪問en.biortus.bio,或關注其相關公眾號。

          SPT Labtech
          SPT Labtech China總部位于上海,系英國SPT Labtech Group全資子公司,專注于生命科學研究領域自動化儀器及耗材的設計與開發,在過去20多年里設計并制造了功能強大、可靠且易于使用的微升級/納升級移液工作站、自動化生物樣本庫,同時提供了在冷凍電鏡和藥物研發領域的解決方案,極大提升了科學家的科研能力。這些產品簡化了關鍵的實驗流程,顯著提高了藥物研發、基因組學、結構生物學及生物樣本庫自動化管理的靈活性、效率和通量生產率。更多信息,請訪問www.sptlabtech.cn

           
          發布者:SPT Labtech
          聯系電話:400-151-8616
          E-mail:marketing@sptlabtech.cn

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