新冠病毒迭代進化、變異情況及毒株之間的關系
自2020年起，COVID-19大流行成為21世紀最嚴重的全球性公共衛生危機之一，它不僅導致了全球范圍內的生命損失和健康問題，還引發了經濟衰退、就業市場動蕩、心理健康危機等。
圖1 SARS-CoV-2結構
新冠病毒顆粒呈圓形或橢圓形，主要包括：刺突糖蛋白（Spike Protein, S）、核衣殼（Nucleocapsid, N）、膜糖蛋白（Membrane Glycoprotein, M）、包膜蛋白（Envelope Protein, E）和RNA基因組。膜糖蛋白和包膜蛋白，對病毒的形態功能和組裝釋放相關。
S蛋白、N蛋白和RBD（受體結合域）是病毒的關鍵組成部分，它們在病毒的感染機制、免疫反應和疫苗開發中發揮著重要作用。
圖2 刺突糖蛋白結構
S蛋白由S1和S2兩個亞基組成。S1亞基包含RBD，負責與宿主細胞表面的ACE2受體結合，而S2亞基則參與病毒與宿主細胞膜的融合過程。S蛋白的RBD區域決定了病毒對宿主細胞的特異性和感染力。
N蛋白以串珠的形式結合到RNA基因組上，形成螺旋對稱的核衣殼結構，與病毒RNA相互作用形成核糖核蛋白復合體（RNP），是病毒的核心。在病毒的復制和轉錄過程中發揮重要作用，并且參與病毒的組裝過程，N蛋白也是疫苗設計和藥物開發的潛在靶點。
病毒進化
隨著病毒序列不斷發生突變，新的變體不斷出現，病毒進化產生的新毒株可能具有更高的逃逸能力、傳播能力或可能加重重癥風險。面臨這些挑戰我們也必須做出快速響應，持續監測病毒變異情況以及治療方法。
圖3 新冠基因組主系進化關系示意圖
KP.2
KP.2(JN.1.11.1.2)是新冠病毒奧密克戎JN.1變異株的第三代亞分支，也是JN.1變異株中具有較強傳播優勢的一個亞分支。KP.2的有三個新增變異位點，其中兩個在S蛋白上。
KP.2擁有更高的病毒適應度，可能成為世界范圍內的主要譜系。根據基因組檢測數據評估發現KP.2的相對有效繁殖數Re在USA、UK和加拿大，KP.2的Re分別是JN.1的1.22倍、1.32倍和1.26倍。截止2024年4月，UK估計KP.2的變異頻率已經高達20%。使用BXX1.5疫苗血清和XBB.1.5、EG.5、HK.3和JN.1突破感染患者血清進行中和滴度檢測，發現KP.2的逃逸能力也遠高于JN.1。WHO在5月3日將KP.2列入“需要檢測的變異株”。
除KP.2外，BA.2.75、BA.4、BA.5、XBB和JN.1也是一些備受關注的變異株。BA.2.75具有多個關鍵的S蛋白突變，特別是受體結合域（RBD）的突變，有較高的ACE2結合親和力；BA.4和BA.5具有高逃逸特性已成為多個國家和地區的主要流行株；XBB是新冠病毒奧密克戎變異株的一個特殊亞型，屬于重組變異株，它們可能由兩種或以上的病毒株的遺傳物質組合而成；而JN.1是BA.2.86的新型變體，繼承了BA.2.86的抗原多樣性和額外的L455S突變，JN.1可通過降低與ACE2的結合來實現更高的免疫逃避能力，世衛組織也將JN.1單獨列為需留意的新冠變異株。
S-RMab®蛋白
斯達特也一直關注病毒迭代進化，上新近40款新冠蛋白與抗體，覆蓋新冠KP.2、JN.1、XXB等多種流行病株，為新冠研究提供核心原料。
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參考文獻
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