EVIDENT助力功能化納米針芯片解析活細胞中lncRNA和RBP的異質性

長鏈非編碼RNA（lncRNA）是一種長度超過200個核苷酸且不編碼蛋白質的RNA分子，它們通過與RNA結合蛋白（RBP）的動態相互作用成為重要的表觀遺傳調節因子。揭示lncRNA與RBP在活細胞中的相互作用對于研究它們在各種生物活動中的作用具有重要意義，然而目前傳統方法均需要對細胞進行裂解，然后分離出細胞中的目標物，從而失去活細胞中的動態異質性信息。

最近，中國科學院蘇州納米技術與納米仿生研究所的裴仁軍、王子迅團隊聯合香港城市大學史鵬團隊開發了一種分子信標功能化的納米針芯片技術（Nano-SpatiaLR），用于在空間上分析lncRNA-RBP相互作用。該技術能夠在保證細胞活性的前提下，以單細胞的分辨率提供細胞內lncRNA-RBP相互作用的空間異質性信息。
 

 
研究人員借助功能化的納米針芯片，利用其獨特的高縱橫比結構和良好的生物相容性的優勢，開發出了在單細胞空間分辨率下檢測lncRNA-RBP相互作用的技術。這種創新的方法可以同時捕獲目標lncRNA及其相關的RBP，并將它們從活細胞內環境中分離出來。隨后，將分離的蛋白直接在納米針芯片上進行檢測和可視化，使其信號與lncRNA的信號共定位，從而做到對lncRNA-RBP復合物的全面定量分析。

圖1. Nano-SpatiaLR的設計與分析原理。
圖片來源：J. Am. Chem. Soc. 2024, 146, 30, 20878–20890.

圖2. MCF-7和HLF-1共培養系統中LncRNA-RBPs空間異質性定位。
圖片來源：J. Am. Chem. Soc. 2024, 146, 30, 20878–20890.

圖3. 追蹤lncRNA-RBP在結直腸癌細胞增殖中的時空交互異質性。
圖片來源：J. Am. Chem. Soc. 2024, 146, 30, 20878–20890.

激光掃描共聚焦顯微鏡FV4000

超分辨轉盤共聚焦顯微成像系統SpinSR

更多精彩內容，敬請關注我們的視頻號：