單細胞測序與空間轉錄組學數據分析培訓班通知

【會議背景】
單細胞測序是從單個細胞水平對基因組和轉錄組進行研究。2015年以來，10X Genomics、Drop-seq、Micro-well、Split-seq等技術的出現，徹底降低了單細胞測序的成本門檻。自此，單細胞測序技術被廣泛應用于基礎科研和臨床研究。通過單細胞測序可以最大程度的反映細胞的異質性，發現新的細胞群和細胞亞群，并為闡明細胞狀態轉換的調控機理提供了技術保障。單細胞技術以及數據分析方法在腫瘤、發育生物學、免疫學、神經科學等領域有重要應用，是現今生命科學研究的焦點。
常規單細胞轉錄組測序技術丟失了細胞在原組織中至關重要的空間位置信息，而單細胞空間轉錄組技術在進行單細胞轉錄組測序的同時保留并記錄了細胞的空間位置信息。空間轉錄組技術能夠揭示細胞間的相互作用以及細胞所處的微環境，將成為發育生物學、神經生物學、免疫生物學、腫瘤微環境等領域的研究利器。
【會議特色】
本次課程以近期CNS文章為案例主線，逐一詳細剖析，全程電腦實戰教學。理論與實踐相結合，老師將以最簡單易懂的方式，既介紹單細胞測序的研究方法、分析內容和最新前沿進展，又介紹具體的數據庫、工具和軟件的使用，并在課堂上進行上機指導。講師經驗豐富，教學深入淺出，能讓大家獲得從單細胞組學原始數據實現CNS圖形繪制的實戰能力。
【講師簡介】
來自中科院，長期從事單細胞多組學方面的項目研究，目前已在Nature等雜志發表文章四十多篇，承擔國家科技部、國家自然基金委和重點研發計劃等多項課題。
【預期目標】
本學習班由多年從事單細胞組學研究的科研人員授課，通過深入淺出的理論講解和實例案例，幫助學員拓展研究思路，提升科研水平，增加職業競爭力。通過本次課程培訓將使學員系統掌握當前主流的單細胞組學分析流程、方法和軟件，從零基礎實現到CNS圖表的繪制，同時提升研究深度和廣度，拓寬研究思路。
【主要內容】
1.熟悉單細胞組學圖表解讀和研究思路。
2.掌握單細胞組學分析標準流程和常用軟件。
3.熟悉單細胞數據的分型和marker基因鑒定。
4.掌握單細胞數據的軌跡分析及功能富集分析。
5.了解單細胞課題設計方法及研究思路。
6.熟悉并掌握單細胞空間轉錄組學實用技能
【課程內容】

第一天上午 9:00-12:00	單細胞測序技術與應用	1. 單細胞組學技術的發展和原理。 2. 單細胞在各個科研領域的應用。 3. 單細胞高分文章分析思路解析（細胞群鑒定、擬時序分析、差異表達、功能富集、轉錄因子、細胞通訊等）。 4. 單細胞組學分析常用數據庫介紹及使用。	理論
第一天下午 14:00-17:00	單細胞組學數據分析實操	1. R語言簡介及安裝，RStudio的安裝及使用說明。 2. R語言語法介紹及常用命令。 3. R語言的數據處理功能及統計應用。 4. 10X官方單細胞軟件Cellranger講解及實操。 5. 從基因表達矩陣開始到marker基因篩選全過程講解及實操。 6. 通過Seurat軟件進行PCA及tSNE降維。 7. 單細胞轉錄組細胞鑒定及聚類分析。 8. 單細胞轉錄組差異分析。	實操
第二天上午 9:00-12:00	單細胞轉錄組軌跡、通路、轉錄因子等分析及繪圖實操	1. 通過Seurat 合并多樣本及消除樣本異質性。 2. 通過Monocle軟件進行單細胞轉錄組擬時間分析。 3. 通過DAVID及metascape網站進行通路富集分析。 4. 通過GSVA計算細胞通路得分信號等。 5. 通過cellphonedb進行細胞互作分析。 6. 通過infercnv推斷染色體拷貝數變異。 7. 通過SCENIC軟件進行轉錄因子預測分析。	實操
第二天下午 14:00-17:00	空間轉錄組+單細胞測序聯合分析	1. 空間轉錄組基本概念及原理。 2. 單細胞及空間轉錄組研究思路及案例分享。 3. 單細胞和空間轉錄組聯合課題設計。 4. 空間轉錄組數據分析。 5. 通過Seurat進行空間變量特征的識別。 6. 與單細胞數據關聯分析（空間細胞類型定義）。 7. 通過Seurat處理多個切片。	理論+實操
備注: 自備電腦，windows電腦建議win10 64位以上系統，內存不低于4G，建議8G以上。上課主要軟件為R和Rstudio。

會議時間：2022年8月20-21日
會議地點：騰訊網絡會議
主辦單位：北京華斯泰生物醫學科技有限公司、合肥華斯泰生物醫學科技有限公司
收費標準：會務費：3000元/人，此次課程為線上直播教學模式，開課前統一提供配套電子版培訓資料。參加培訓的學員課后可通過微信群繼續和授課講師交流，長期獲得指導機會。
課程結束后統一快遞紙質版蓋章通知和正式發票，如提前需要請聯系會務組。
繳費方式:
本次會議費委托合肥華斯泰生物醫學科技有限公司收取并統一提供會務發票。
1. 網上匯款或銀行轉賬
戶　名：合肥華斯泰生物醫學科技有限公司
開戶行：中國銀行合肥臨泉路支行
帳　號：181246448304
2. 支付寶賬號
名字：合肥華斯泰生物醫學科技有限公司
賬號：kf@Huasitai.com
注：匯款時請務必注明“單細胞”和學員姓名，匯款后將回單電子郵件發給我們，以便我們確認。
報名方式:
請填寫 報名表 通過電子郵件發送至: info@huasitai.com，或在線報名(www.Huasitai.com)
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會務咨詢:
聯系人：章老師 
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mail：info@huasitai.com
網 站：www.huasitai.com


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