SBC單細胞轉錄組測序及生信分析培訓班報名通知

瀏覽次數：11766　發布日期：2019-9-27　來源：本站　本站原創，轉載請注明出處

自今年6月第一期單細胞轉錄組測序及生信分析培訓班成功舉辦以來，陸續收到新用戶詢問單細胞測序的培訓課程，結合第一期學員的反饋和建議，SBC茲定于2019年10月24日-26日再次舉辦第二期進階版的單細胞轉錄組測序及生信分析培訓班。針對學員們的不同需求，本次培訓班為期三天，包含基礎課程（第1天）及進階課程（第2-3天）兩部分。

課程內容涵蓋10Xgenomic單細胞測序原理、樣本準備、分析流程及原理、R語言基礎、高級分析以及實驗設計策略等。本次培訓班特別邀請到上海交通大學系統生物醫學研究院副研究員鄒欣博士在第三天的課程中授課。

誠摯邀請各位老師報名參加，本次培訓班實行小班制（限額20人）。

主辦單位：上海生物芯片有限公司/生物芯片上海國家工程研究中心

培訓日期：2019年10月24日-26日
培訓地點：上海市浦東新區張江高科技園區李冰路151號1號樓

一、 日程安排（暫定）

日期	時間	主題	課程內容
10月24日第一天	08:45-09:00	簽到、領取資料
	09:00-09:10	開課致辭
	09:10-10:00	非編碼RNA研究概述及數據解讀
	10:00-11:00	R語言基礎	基本概念：向量、數組和矩陣、函數；數據導入、編輯、數據結構轉換；文件圖表生成、導出
	11:10-11:40	R語言進階：統計檢驗，差異基因計算
	13:00-14:00	ggplot2詳解（柱狀圖、餅圖、boxplot、小提琴圖、密度曲線圖，散點圖，差異基因可視化（火山圖）等）
	14:00-14:40	如何畫非常牛的hclust層次聚類圖
	15:00-15:30	heatmap詳解&韋恩圖詳解
	15:40-16:40	GEO數據庫詳解及常用文章繪圖（誤差線圖、生存曲線圖、jitterplot）
10月25日第二天	08:45-09:00	簽到、領取資料
	09:00-09:10	開課致辭
	09:10-09:55	單細胞測序介紹	單細胞測序技術的發展及10Xgenomic單細胞測序原理介紹
	10:00-10:30	樣本準備	單細胞樣本準備及常見問題
	10:40-11:30		Demo實驗
	13:10-13:40	10X單細胞轉錄組分析原理及流程介紹
	13:45-14:00	10XGenomoics 單細胞轉錄組數據分析介紹與上機實操	Cellranger運行環境、服務器配置，如何從fastq生成表達矩陣等系列結果; Loupe Cell Browser軟件使用
	14:05-15:40	單細胞轉錄組數據多樣本比較分析介紹與上機實操	使用Seurat進行全套單細胞轉錄組數據分析演練：常見7類分析圖：DimPlot_Integret、DotPlot、FeaturePlot整合圖等的代碼解析
	15:45-16:15	單細胞轉錄組結果報告解讀
	16:20-17:00	10X單細胞ATAC-seq分析流程及原理介紹	CellRanger-ATAC運行、運行過程中使用算法介紹及結果解讀； Loupe Cell Browser軟件運行、ChIPseeker對peaks結果注釋、Cicero介紹
10月26日第三天	09:00-09:40	單細胞ATAC結果報告解讀
	09:55-11:30	單細胞數據中的噪聲干擾以及解決方案特邀嘉賓：上海交通大學副研究員鄒欣博士
	13:00-14:00	高級分析案例分析；流程演練+實操過程答疑	1、Monocle的原理算法介紹；2、高分文章案例數據集作圖：擬時序分析等
	14:10-15:00	單細胞RNA測序數據的聚類工具比較介紹	聚類方法比較（包括Seurat、Cell Ranger、SC3、ascend、RaceID）
	15:30-16:30	單細胞測序技術的應用與實驗設計思路解析
	16:30-16:40	頒發證書、合影

二、費用及優惠

1、培訓費用：

培訓課程	課程時間	培訓費
基礎班	10月24日（共1天）	1000元/人
進階班	10月25日-26日（共2天）	2000元/人
實戰班	10月24日-26日（共3天）	2800元/人
注：以上費用包含培訓費、資料費、培訓期間午餐費。