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          上海生咨生物2014屆生物信息學暑期研習班邀請函

          瀏覽次數:4056 發布日期:2014-6-5  來源:本站 本站原創,轉載請注明出處
          2014屆生物信息學暑期研習班邀請函
          2014年7月22-26日,上海海荷歐風酒店
           
          尊敬的老師:
           
          您好!
           
          上海生咨生物科技有限公司盛情邀請您參加2014屆生物信息學暑期研習班。本次研習班將在2014年7月22日至7月26日在上海舉辦。
           
          本次研習班從基因組學(基因組高通量測序數據分析),轉錄組(RNAseq數據分析、miRNA數據分析、表達譜芯片分析)、蛋白質組(iTRAQ數據分析)、進化分析等多個方面講解各種組學數據的分析方法。研習班將由多年從事生物信息學分析研究的科研專家和技術工程師共同授課,通過深入淺出的理論講解和上機操作,幫助學員深入了解從基因組-轉錄組-蛋白質組的研究思路和數據分析方法,幫助學員拓展研究思路,掌握一些數據分析的方法。
           
          本次研習班適合:
          1、零生物信息學知識但想要了解生物信息學的學員;
          2、正在或者將進行組學研究的科研人員;
          3、已有組學數據需了解分析方法的研究人員;
          4、想要將來從事生物信息學方向工作的學生或者工作人員。
           
          主辦單位:上海生咨生物科技有限公司
          協辦單位:上海產業技術研究院藥物轉化創新中心
          支持單位:杭州谷禾信息技術有限公司
           
          時間:2014年7月22日-2014年7月26日
          地點:海荷歐風酒店,上海市閘北區共和新路1301號
           
          課程安排:2014年7月22日-7月26日,報到時間2014年7月21日下午14:30- 17:30。

           

          時間
          課程內容
          注冊
          7月21日 12:30 - 17:30
          7月22日 8:30 - 9:30
          會議注冊
          第一天(7月22日)
          (基礎知識和數據庫)
          9:30-11:45
          生物信息學導論
          13:30-16:45
          Linux基礎和軟件安裝
          常用數據資源介紹(NCBI、 UCSC、UniProt等介紹)
          第二天(7月23日)
          (基因組測序數據分析)
          9:30-16:45
          基因組組裝策略及方法
          三代pacbio測序數據分析
          基因組重測序及數據分析
          微生物基因組功能注釋
          真菌基因組功能注釋
          上機操作:tablet,snpeff,velvet,BWA,
          samtools, annovar,GATK等
          第三天(7月24日)
          (轉錄組測序數據分析)
          9:30-16:45
          RNAseq數據分析
          miRNA數據分析
          上機操作:BWA,samtools,cufflinks等
          第四天(7月25日)
          (進化分析和基因芯片)
          9:30-16:45
          進化分析
          上機操作(clustalx,MEGA, phylip, Mrbayes等)
          基于表達譜芯片的臨床數據分析
          基因表達譜芯片數據分析及其基本處理流程
          (上機操作:R分析)
          第五天 (7月26日)
          (蛋白質組)
          9:30-16:45
          蛋白質鑒定和質量控制
          提高蛋白鑒定覆蓋度
          蛋白質搜庫上機
          蛋白質組數據分析(GO功能分類和富集分析
          通路分析,網絡構建)
          上機操作:DAVID, Cytoscape+ BiNGO, GSEA, CateGOrizer,Cluster+Treeview,Mev,MotifX等。
          注:
          1.課程具體安排以報名當天的課程表為準。
          2.應需要上機練習,請攜帶筆記本電腦,建議配置為4G內存,10G空余硬盤空間。
           
          收費標準
          工作人員4600元/人,在校學生4100元/人 (含資料費和中餐)
           
          其他優惠:
          1、同一單位2人以上參加蛋白質組學前沿技術研習班,每人優惠200元。
          2、2014年7月5日之前匯款優惠200元,以匯款回執時間為準。
          3、上海生咨生物科技有限公司的客戶或之前參加過研討班學員推薦學員優惠300元。
          以上優惠可同時享受。
           
          交通住宿費用自理,住宿預定需提前一周預定。
          住宿協議酒店為海荷歐風酒店(準四星酒店)
          協議價: 豪華標準房280元/天(含雙早)。注:合住每人140元/天,若湊不到合住的學員需支侍全價。
               豪華大床房280元/天(含雙早)。
          名額有限,提前匯款學員可優先選擇前排座位,報名后因有事無法參加的學員請提前1周聯系我們。
           
          點此下載報名回執表
           
          付款方式:
          1.  匯款:上海生咨生物科技有限公司 
          開戶銀行:中國農業銀行上海星火支行
          匯款帳號:03805500040008016
          請在匯款前與我們電話聯系,匯款后將回單電子郵件發給我們,以便我們確認,匯款請注明“會議”+您的姓名。
           
          聯系人:
          許丹丹(ddxu@biorefer.com; 1377122204@qq.com)
          手機: 189-1780-5836  座機:021-31131531
          QQ: 1377122204
           
          備用聯系人:
          俞鴻 (hyu@biorefer.com; 425217020@qq.com)
          手機:15900766827
           
          2. 研習班報到當天現金支付。
           
          講課專家信息
          李亦學 教授
          上海生物信息技術研究中心主任,中科院上海生命科學研究院系統生物學重點實驗室副主任,研究員,博士生導師。上海生物信息學會理事長,中科院“十一五”信息化專家組專家。曾任國家中長期發展規劃第十五專題組副組長,上海市2002年科學預見專家,中國科學院計劃局生命科學領域戰略發展專家組專家,國家“十五” 863計劃生物和農業技術領域生物信息技術主題專家組組長,國家科技部中英E-Science國際合作計劃中方協調人。研究方向:蛋白質組學研究,系統生物學研究。
           
          蔡曉輝   副研究員
          中國科學院上海生化細胞所獲生物信息學博士學位,畢業后先后在美國印第安娜大學計算生物學和生物信息學中心,加州大學圣地亞哥分校生物系統研究中心作為訪問學者從事博士后工作。2011年至今在上海生物信息技術研究中心任副研究員工作。研究方向包括蛋白質序列、結構與功能關系,蛋白質重要功能位點的識別,蛋白質組學數據分析以及二代測序數據分析,生物信息學數據庫和生物信息學算法開發等。
           
          賈佳
          新加坡海歸生物信息學博士 上海生物信息技術研究中心副研究員,生命科學數據中心負責人,主要從事生物醫藥信息數據資源開發和整合技術的研究。
           
          金谷雷
          浙江大學生物信息學博士杭州谷禾信息技術有限公司 總經理 從事生物信息研究近10年,參與了包括國家973、863計劃以及自然科學基金等項目。研究階段獨立研發了Biopubinfo知識網絡平臺。擅長高通量測序數據分析。
           
          徐昊 
          2001年起從事生物信息學數據分析工作,同濟大學生物工程碩士,分別在華大基因、上海生物信息技術研究中心、眾信生物技術有限公司擔任數據分析工程師職務,曾獲得國家杰出科學家證書。曾經擔任過超過10期生物信息學培訓班講師,有豐富的培訓經驗。熟悉常用數據庫以及分析軟件,生物信息學擅長分析領域為RNA-seq、微生物基因組分析,分析超過百個cDNA文庫和RNA-seq庫,對金黃色葡萄球菌,鉤端螺旋體、黃單胞菌等做過深入分析。
           
          于復東
          博士、副研究員。
          2008年1月畢業于中國科學院上海生命科學研究院,獲生物信息學博士學位。畢業后一直從事二代測序等高通量數據分析、腫瘤基因組學、及相關數據庫開發和分析平臺建立等生物信息學研究工作。目前主要從事腫瘤基因組學方面的研究工作,運用系統生物學的方法研究可以應用于臨床早期診斷、預后、復發和轉移相關的分子標志物基因及其功能等。近年來作為項目負責人完成了國家自然科學基金、上海市博士后基金、上海市白玉蘭科技人才基金各一項,作為生物信息學分析平臺負責人完成傳染病重大專項課題一項,作為技術骨干參與完成863計劃項目一項,累積發表SCI論文十余篇。
           
          俞鴻 
          現任上海生咨生物科技有限公司經理,資深生物信息學工程師. 具有超過10年生物信息學分析經驗。參與了水稻基因組、家蠶基因組、人肝蛋白質組計劃以及其他的國家973、863計劃及國家自然科學基金等項目。主要從事蛋白質組、基因組方向的分析。
           
          會議地點及交通路線:
          培訓地點:海荷歐風酒店,共和新路1130號
          上海虹橋機場(二號航站樓)距離酒店30公里;乘出租車約40分鐘,約80元可到酒店。坐2號地鐵到人民廣場換1號線到中山北路站下。
          上海浦東國際機場距離酒店44.17公里;乘出租車約45分鐘,約160元可到酒店。坐2號地鐵到人民廣場換1號線到中山北路站下。
          上海火車站距離酒店2公里;乘出租車約5分鐘,約14元可到酒店。地鐵坐1號線到中山北路站下。
          上海火車南站距離酒店20公里;乘出租車約30分鐘,約60元可到酒店。地鐵坐1號線到中山北路站下。


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