生物信息學(xué)基礎(chǔ)語言-perl語言10月開班通知

Perl語言作為絕大多數(shù)生物信息學(xué)工作者首選語言之一。北京市計算中心生物計算事業(yè)部針對沒有任何計算機語言的生物學(xué)、醫(yī)學(xué)、農(nóng)學(xué)等人員，且有從事生物信息學(xué)工作相關(guān)研究工作的需要。歡迎您報名參加！

主辦單位：北京市計算中心，生物計算事業(yè)部

舉辦地：北京，北京市海淀區(qū)豐賢中路7號北科產(chǎn)業(yè)3號樓

培訓(xùn)時間：2013年10月22日-25日 

日期	授課題目	授課內(nèi)容
第一天	生物信息學(xué)與Perl語言概述	概括介紹生物信息學(xué)背景與Perl語言的概念及特點
	軟件安裝與運行環(huán)境調(diào)試	Perl語言解釋器、編輯器安裝，Perl程序運行測試
	基本操作與基本概念	DOS、Unix命令行操作基本命令；Perl語言基本變量與操作符
	基本變量	變量、字符串賦值、基本運算等練習(xí)
第二天	基本語法結(jié)構(gòu)	判斷結(jié)構(gòu)；循環(huán)結(jié)構(gòu)；練習(xí)
	數(shù)組及應(yīng)用	數(shù)組的概念及用法；練習(xí)
第三天	文件與文件夾操作	文件的讀入與輸入；文件夾操作；練習(xí)
	二維數(shù)組與hash表及應(yīng)用	二維數(shù)組概念、關(guān)聯(lián)數(shù)組(hash表)概念及用法；練習(xí)
	常用函數(shù)及子程序	常用Perl語言基礎(chǔ)函數(shù)學(xué)習(xí)；子程序概念與應(yīng)用；練習(xí)
第四天	正則表達式及生物信息學(xué)Perl程序?qū)嵗?/DIV>	Perl特色功能正則表達式學(xué)習(xí)與應(yīng)用；生物信息學(xué)實例程序?qū)W習(xí)；練習(xí)
	Bioperl簡介、CPAN簡介、常用生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫與軟件簡介	Bioperl簡介與安裝；Perl第三方代碼庫CPAN簡介；常用生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫簡介、數(shù)據(jù)類型與應(yīng)用；常用生物信息學(xué)軟件數(shù)據(jù)格式及軟件應(yīng)用簡介
授課實例	1、生物學(xué)數(shù)據(jù)文件批量的合并、分隔、去冗余等。 2、生物信息序列數(shù)據(jù)fastq、fasta、genbank文件等格式轉(zhuǎn)換與批量自動化處理。 3、按個性化實驗需求，從生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫文件（如genbank、EMBL）中批量自動化提取特定數(shù)據(jù)信息。 4、表格矩陣型數(shù)據(jù)的行列轉(zhuǎn)換、特定數(shù)據(jù)信息的自動化過濾與數(shù)據(jù)篩選等。 5、二代測序原始數(shù)據(jù)的批量過濾處理，如barcode識別、質(zhì)量值過濾等。 6、基因、蛋白質(zhì)序列特定位點的識別，如起始、終止位點、ORF、motif、CDS等。 7、生物信息學(xué)數(shù)據(jù)序列特征提取與自動化統(tǒng)計，如GC百分含量、k-mer統(tǒng)計、基因反向互補轉(zhuǎn)換等。 8、生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫文件的批量自動化下載與信息提取（選學(xué)）。

1、對口生物信息；    2、非嚴(yán)格語法，適合初學(xué)；

3、功能強大、跨平臺；4、有巨大的第三方代碼庫CPAN

【報名費用】  注冊費：2800元/人（含聽課費、資料費、上機費、午餐，請自帶筆記本電腦以備上機實踐使用），主辦方可協(xié)助安排入住酒店，住宿費用自理。

【付費方式】現(xiàn)金、支票、銀行轉(zhuǎn)賬、銀行匯款

單位全稱：北京市計算中心      賬號：0200151819100023937 

開戶銀行：中國工商銀行股份有限公司北京永豐支行

1、    開課前20天報名的學(xué)員每人可減少200元（10.2以前）；

開課前10天報名的學(xué)員每人可減少100元（10.12-10.2）；

   2、 3人以上團體報名的學(xué)員每人可減少200元；

   3、 任意兩班同時報名可減少300元（需一次性繳費）；

   4、 4+1團報，可免費贈送一個名額                

   5、 上面4種優(yōu)惠政策不能同時享受，只能享受其中一種。

   6、 老學(xué)員、老學(xué)員介紹的學(xué)員均可以再優(yōu)惠100元。

1、 已經(jīng)成功付款的學(xué)員，如在開課前7個工作日前聯(lián)系主辦方撤銷席位，可退還100%的注冊費用；如在開課前3個工作日內(nèi)（含3個工作日）要求撤銷席位則退還80%的注冊費用。

2、 撤銷席位后，學(xué)員可提交延期申請，可參加當(dāng)前時間到2013.12.12日期間由北京市計算中心舉辦的各類培訓(xùn)，費用將采取多退少補原則。逾期不參加任何培訓(xùn)課程可申請退款，退款期間產(chǎn)生的所有費用由學(xué)員本人承擔(dān)

【請聯(lián)系】張利英  010-59341771 ，18618295767，QQ號：2814500767，郵箱：zhangly@bcc.ac.cn

員麗麗   010-59341773, 18701529461 ,  郵箱：yuanll@bcc.ac.cn

 

培訓(xùn)班類型：（可多選）

□實用生物信息學(xué)培訓(xùn)班  □論文發(fā)表所需的圖表處理實用技能 □生物信息與宏基因組分析專題研討班  □Perl語言專題班

姓名：

性別

民族：

職稱：

身份證號

工作單位：

住宿：

是□；否□

研究方向：

報名時間：

通訊地址：

郵編：

固定電話：

手機：

E-mail:

報名種類：

A□           B□             （該選項僅報名生物信息培訓(xùn)班人員填寫）

對課程了解情況

☆☆☆☆☆

感興趣的課程：

信息渠道:

□中心主頁 □郵件宣傳（張利英、員麗麗）□海報 □單頁 □銷售員  □丁香園  □生物論壇  □生物通郵件、主頁   □朋友推薦  □老學(xué)員推薦（  姓名  ） □是否有優(yōu)惠卷

發(fā)票抬頭：

發(fā)票內(nèi)容：

住宿明細

入住時間： 離店時間：

房間類型

□大床間 □標(biāo)準(zhǔn)間（和       合住） □拼房（與其他學(xué)員拼標(biāo)準(zhǔn)間）

備注：