“從芯片到新一代測序”講座-上海交大醫學院（5.20）

 

表觀遺傳的改變（基因組DNA甲基化、組蛋白修飾等）以及轉錄因子與DNA的相互作用都可以在轉錄水平調控基因的表達，并與生物體正常生理過程以及疾病發生發展密切相關。講座將介紹基于高通量芯片和Illumina GA IIx測序平臺的高通量檢測技術及應用：包括MeDIP-chip、ChIP-chip、MeDIP-Seq、ChIP-Seq。

 

長鏈非編碼RNA(lncRNA)作為長度超過200nt的非編碼RNA,與microRNA為代表的small ncRNA, 在表觀遺傳、轉錄及轉錄后等多個層面調控基因表達。講座將介紹非編碼RNA的多種研究方法及應用，包括microRNA表達譜芯片，最新推出的lncRNA表達譜芯片，以及Illumina GA IIx新一代測序技術在非編碼RNA研究中的應用。

 

實時定量PCR芯片，結合了芯片高通量和實時定量PCR準確性的優點，廣泛應用于各種疾病和正常生長發育機制的研究。講座將系統介紹PCR array的應用，一次精確檢測幾十到幾百個不同基因，有超過100種不同信號轉導通路或疾病研究的方向可供選擇；講座還將介紹專門用于研究microRNA表達的PCR array。

 

全基因組表達譜芯片可一次性檢測所有已知基因（mRNA）的表達水平，是目前應用最廣泛的生物芯片技術平臺。講座將介紹表達譜芯片技術與生物學研究尤其是疾病研究的有效結合，重點涉及實驗設計與芯片數據的深入挖掘。

 

 

時間：2010年5月20號（星期四）下午14：00-16：00（講第二、第四部分）

地點：上海交通大學醫學院5號樓11樓免疫學研究所會議室

          （上海市重慶南路280號5號樓11樓會議室）

 

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