國家生化工程技術研究中心是根據國家生物技術產業化研究的需要，于1996年由中國科學院過程工程研究所（原化工冶金研究所）與華東理工大學、南京工業大學聯合申請成立的國家級生化工程技術研究中心。中國科學院過程工程研究所負責國家生化工程技術研究中心（北京）的建設，于2000年通過國家科技部的驗收。

國家生化工程技術研究中心（北京）與生化工程國家重點實驗室相互協作，以分離純化介質和分離純化工藝為主要核心技術，在蛋白質（包括疫苗、抗體、酶以及細胞因子等生物活性分子）、多肽以及天然產物有效成分的分離純化等領域取得了一定的成績，并與生物技術上游單位和部分制藥企業合作（GE公司、Pfizer公司、華蘭生物、雙鷺藥業、貝達藥業、中國生物制品檢定所、武漢生物制品研究所等），進行技術的放大和產品的規模化生產，形成了對生物產品制備過程進行理論研究及應用開發的產學研基地。國家生化工程技術研究中心（北京）目前可提供的產品主要有分離純化介質、細胞培養微載體、藥物緩控釋載體以及酶固定化載體等。